如果职工因违法违规被停职,一般只发基本工资。如果是职工主动申请停职,工资将会全部被停发。每个单位、部门的相关规定不尽一致,
一、什么是“停职查看”?
“停职查看”是很多企业较为惯用的一种处分手段，通常是在员工出现违法违纪事实时，通过对员工在一定期限内停止工作的约束来要求员工反省自觉、纠正错误，同时由用人单位对停职员工是否继续留用及服务的岗位、职责、待遇等进行重新考量和判断。
与其他违纪处分手段一样，虽然都是用人单位自主管理权的体现，但毕竟涉及员工的劳动权利及劳动报酬，法律法规对此有明确的规范和保障，也就需要用人单位更加注意依据和尺度。
二、相关法律法规
原劳动部办公厅《关于处理劳动争议案件若干政策性问题的复函》(劳办发[1994]322号)第2条规定，关于职工被停工、停职检查扣发工资和生活费问题，企业对违纪职工用停工、停职的方式进行处理，如有法律、法规依据，要严格按有关法律、法规办理。没有法律、法规依据的，不能采取停工、停职检查期间扣发工资和生活费的做法。
《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释(一)》第19条规定，用人单位根据《劳动法》第4条之规定，通过民主程序制定的规章制度，不违反国家法律、行政法规及政策规定，并已向劳动者公示的，可以作为人民法院审理劳动争议案件的依据。
结论
由此可见，当用人单位需要对员工处以停职查看的处分形式时，须首先明确员工的行为是否构成用人单位依法制定的规章制度中所规定的“违纪行为”;其次，该违纪行为是否可依据规章制度处以停职停薪的处分;再其次，用人单位对停职查看的管理应当设置明确、固定的期限，“查看”的标准、方法、流程，以及复职的条件、时间等。
需要指出的是，停职停薪是在一定时期内对员工进行的处分，劳资双方的权利义务处于暂时的中止履行状态，但劳动关系仍存在。
