一、产生的形式不同：
董事长产生由公司章程规定、总经理产生由董事会任命
一个公司，真正的主人是股东，但是股东往往是投资人，他们需要一些由相关专业背景的人来帮忙管理公司，于是就成立了董事会。董事会作为一个执行组织，需要有自己的领导人，就是董事长。
董事长的选举形式由公司章程规定，毕竟选出来的董事长要带领整个董事会行使执行权，权力很大，所以按照公司章程规定选出来之后还要给股东大会过目，要经过股东大会。
总经理是公司的高管，主要任务就是去落实董事会的决定，所以由董事会直接任命。
决定其报酬的主体不同：董事长由股东会决定、总经理由董事会决定
秉着“谁选出来的，就对谁负责”的原则，董事长不仅要对董事会负责，还要对股东会负责，董事会和股东会一对比那就是执行权和所有权的对比，当然是股东会的所有权比较大，所以董事长每月的工资多少就由股东会说了算。
总经理是由董事会选出来的，理应为董事会负责，所以工资也是由董事会说了算。
二、权限不同：
董事长组织董事会执行股东会决策，经理主持公司日常经营工作。一间公司，越高位的组织需要做越大方向的规划。所以，大的发展方向通常都由股东会来决定，比如说公司的经营理念是什么呀、公司主打产品主打的方向是什么呀;股东会决定了方向之后就轮到董事会按照这个方向去制定经营计划了，为了达到股东会制定的目标，董事会先会计划今年总共要赚多少钱、然后计划一个个的项目来完成年度指标，把各个项目详细地分配到每个部门的总经理身上;接着总经理就拿着这些项目开始组织其下设部门的部长讨论应该开展工作了。
三、二者最大的分别
1、董事长是在董事会的层面发挥作用，职权更务虚，一般是参与制定公司的战略，作为公司代表人等等。但强势的董事长也常常会“越权”，一竿子插到底。具体职权应该，根据公司法和章程及议事规则来确定。
2、董事长和总经理权力大小其实不一定。大家印象中好像董事长权力更大，其实就如上面所说，其权力可能并非来源于董事长的职衔本身。董事长如果能控制董事会，那么就有能力任免总经理、副总经理和其他高管。如果不能，那么总经理的权力可能更大。
3、讨论总经理的权力还有值得一提的有意思的一点。总经理对于副总、财务负责人、(上市公司的)董事会秘书以及章程规定的其他高管，只有提名权，而没有任免权。因此，总经理的权力大小还受其他高管权力边界的影响。由于总经理权力很大，这是一种制衡的手段。
