律师解答：
一、事件性质不同
1、二级响应
突发公共卫生事件二级响应是针对重大的突发公共卫生事件所采取的紧急应对措施，二级响应是仅次于最高级别的应对措施。
2、三级响应
突发公共卫生事件三级响应的级别低于二级响应。
二、危害程度不同
1、二级响应
（1）在一个县（市）行政区域内，一个平均潜伏期内（6天）发生5例以上肺鼠疫、肺炭疽病例，或者相关联的疫情波及2个以上的县（市）。
（2）发生传染性非典型肺炎、人感染高致病性禽流感疑似病例。
（3）腺鼠疫发生流行，在一个市（地）行政区域内，一个平均潜伏期内多点连续发病20例以上，或流行范围波及2个以上市（地）。
（4）霍乱在一个市（地）行政区域内流行， 1周内发病30例以上，或波及2个以上市（地），有扩散趋势。
（5）乙类、丙类传染病波及2个以上县（市），1周内发病水平超过前5年同期平均发病水平2倍以上。
2、三级响应
（1）发生肺鼠疫、肺炭疽病例，一个平均潜伏期内病例数未超过5例，流行范围在一个县（市）行政区域以内。
（2）腺鼠疫发生流行，在一个县（市）行政区域内，一个平均潜伏期内连续发病10例以上，或波及2个以上县（市）。
（3）霍乱在一个县（市）行政区域内发生， 1周内发病10～29例或波及2个以上县（市），或市（地）级以上城市的市区首次发生。
（4）一周内在一个县（市）行政区域内，乙、丙类传染病发病水平超过前5年同期平均发病水平1倍以上。
（5）在一个县（市）行政区域内发现群体性不明原因疾病。
（6）一次食物中毒人数超过100人，或出现死亡病例。
（7）预防接种或群体性预防性服药出现群体心因性反应或不良反应。
（8）一次发生急性职业中毒10～49人，或死亡4人以下。
三、涉及范围不同
1、二级响应
境内外隐匿运输、邮寄烈性生物病原体、生物毒素造成我境内人员感染或死亡的。省级以上人民政府卫生行政部门认定的其他重大突发公共卫生事件。
2、三级响应
市（地）级以上人民政府卫生行政部门认定的其他较大突发公共卫生事件。
【法律依据】：
《国家突发公共事件总体应急预案》
1.6 应急预案体系
全国突发公共事件应急预案体系包括：
突发公共事件总体应急预案。总体应急预案是全国应急预案体系的总纲，是国务院应对特别重大突发公共事件的规范性文件。
突发公共事件专项应急预案。专项应急预案主要是国务院及其有关部门为应对某一类型或某几种类型突发公共事件而制定的应急预案。
突发公共事件部门应急预案。部门应急预案是国务院有关部门根据总体应急预案、专项应急预案和部门职责为应对突发公共事件制定的预案。
突发公共事件地方应急预案。具体包括：省级人民政府的突发公共事件总体应急预案、专项应急预案和部门应急预案；各市（地）、县（市）人民政府及其基层政权组织的突发公共事件应急预案。上述预案在省级人民政府的领导下，按照分类管理、分级负责的原则，由地方人民政府及其有关部门分别制定。
3.3.2 调查与评估
要对特别重大突发公共事件的起因、性质、影响、责任、经验教训和恢复重建等问题进行调查评估。
