遭遇仓储合同纠纷的处理如下:产生仓储合同纠纷后,仓储合同的当事人可以协商进行处理,双方协商不成的可由第三人进行调解,调解不成的可以申请仲裁,不能申请仲裁的可以直接向法院起诉。法律依据:《仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷,可以仲裁。《民事诉讼法》第一百二十五条当事人起诉到人民法院的民事纠纷,适宜调解的,先行调解,但当事人拒绝调解的除外。《民法典》第五百七十七条 当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的,应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。