若员工因为拒绝加班而被公司辞退，那员工可以和公司进行协商申请进行支付赔偿金，若是双方协商不成，那劳动者可以到当地的劳动部门进行诉讼，来申请保护员工自己的合法权益。
用人单位以劳动者不愿意加班，就以劳动者不服从领导安排将其辞退，属于一种违法辞退，劳动者可以要求劳动者支付赔偿金。
用人单位解除与劳动者的劳动关系(或者说辞退、开除)分以下三种情况，可以对照下属于哪种情况，应该支付经济补偿或赔偿而没有支付给的，可以在1年内申请劳动仲裁维护自己的合法权益:
1、用人单位与劳动者解除劳动关系，没有任何合法理由，也没有支付经济补偿，劳动者不存在规定的情形，可以认定该用人单位行为属于规定的违法解除劳动合同情形，应该支付赔偿金，即每工作一年支付2个月的本人工资，俗称2N;
2、用人单位依据规定情形与劳动者解除劳动关系的，其中符合规定的，应该支付经济补偿金，即每工作一年支付一个月本人工资，N;且没有提前1个月通知劳动者的还应多支付1个月工资作为代通知金，俗称N+1;
3、如果劳动者存在规定的情况，用人单位提出解除劳动关系的，不需要支付任何经济补偿，也不需要提前通知;但是，这需要用人单位举证并且书面通知劳动者解除劳动关系。
二、如果用人单位拒绝支付法定节假日加班费怎么办?
劳动者可以申请劳动仲裁要求用人单位支付加班费。不过需要注意收集证明加班的证据，例如考勤表、考勤卡、加班审批单、加班通知、监控录像、证人证言、加班时所做工作形成的书面文字记录、电子邮件等。
目前，在法定节假日实际放假的天数，往往是比法定的天数多的，这是因为其中存在一些与周末调休的情况。因而，当我们在计算法定节假日加班工资的时候，首先就要明确究竟是调休的时候加班，还是在法定放假的期间加班。
综上所述，因员工拒绝加班而对其进行辞退，这样的行为是不合理的，也是不允许的，且员工进行加班时候，公司一定要给予其相应的加班报酬，若是节假日或休息日，加班费应该翻倍。
