符合作废条件，增值税专用发票已经认证可以作废。
《国家税务总局关于修订的通知》规定，
第十三条
一般纳税人在开具专用发票当月，发生销货退回、开票有误等情形，收到退回的发票联、抵扣联符合作废条件的，按作废处理;开具时发现有误的，可即时作废。
作废专用发票须在防伪税控系统中将相应的数据电文按‘作废’处理，在纸质专用发票(含未打印的专用发票)各联次上注明‘作废’字样，全联次留存。
第十四条
一般纳税人取得专用发票后，发生销货退回、开票有误等情形但不符合作废条件的，或者因销货部分退回及发生销售折让的，购买方应向主管税务机关填报《开具红
字增值税专用发票申请单》(以下简称《申请单》)。
《申请单》所对应的蓝字专用发票应经税务机关认证。
经认证结果为‘认证相符’并且已经抵扣增值税进项税额的，一般纳税人在填报《申请单》时不填写相对应的蓝字专用发票信息。
企业如何处理已抵扣的增值税专用发票？
律师回答
摘要：增值税专用发票可根据作废条件进行作废。根据国家税务总局的通知，一般纳税人在开具专用发票时发现销货退回或开票有误等情况，可按作废处理。作废需在防伪税控系统中处理数据，并在纸质发票上注明作废。若不符合作废条件或因销货部分退回及销售折让，购买方需填报《开具红字增值税专用发票申请单》，并经税务机关认证。若认证结果为“认证相符”且已抵扣增值税进项税额，填报申请单时无需填写相应蓝字专用发票信息。
延伸阅读
增值税专用发票的抵扣政策与企业财务管理
企业在处理已抵扣的增值税专用发票时，需要遵循相关的抵扣政策，并将其纳入企业的财务管理体系中。根据税法规定，企业可以将符合条件的增值税专用发票用于抵扣应纳税额，以减轻税负。在实际操作中，企业应注意以下几点：首先，确保所抵扣的专用发票与企业的实际经营活动相符，并保留相关的购销合同、发票等证明材料。其次，按照税法规定的时限和程序，将抵扣发票信息及时、准确地报送给税务部门。此外，企业还应建立健全的内部控制机制，确保抵扣发票的真实性和合法性。通过合规的增值税专用发票抵扣政策与企业财务管理的结合，企业可以有效降低税负，提升财务管理水平。
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结语：根据国家税务总局的规定，一般纳税人在开具增值税专用发票时，如果发生销货退回、开票有误等情形且符合作废条件，可以进行作废处理。作废专用发票需要在防伪税控系统中进行相应处理，并在纸质专用发票上注明作废字样。如果发票不符合作废条件，或者发生销货部分退回和销售折让等情形，购买方需要填报《开具红字增值税专用发票申请单》，并经过税务机关认证。企业在处理增值税专用发票时，应遵循相关抵扣政策，并建立健全的内部控制机制，以确保抵扣发票的真实性和合法性，从而降低税负，提升财务管理水平。
法律依据
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第六章 特别纳税调整 第一百二十一条 税务机关根据税收法律、行政法规的规定，对企业作出特别纳税调整的，应当对补征的税款，自税款所属纳税年度的次年6月1日起至补缴税款之日止的期间，按日加收利息。
前款规定加收的利息，不得在计算应纳税所得额时扣除。
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第六章 特别纳税调整 第一百二十二条 企业所得税法第四十八条所称利息，应当按照税款所属纳税年度中国人民银行公布的与补税期间同期的人民币贷款基准利率加5个百分点计算。
企业依照企业所得税法第四十三条和本条例的规定提供有关资料的，可以只按前款规定的人民币贷款基准利率计算利息。
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第五章 源泉扣缴 第一百零五条 企业所得税法第三十七条所称支付，包括现金支付、汇拨支付、转账支付和权益兑价支付等货币支付和非货币支付。
企业所得税法第三十七条所称到期应支付的款项，是指支付人按照权责发生制原则应当计入相关成本、费用的应付款项。
前款规定加收的利息，不得在计算应纳税所得额时扣除。
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第六章 特别纳税调整 第一百二十二条 企业所得税法第四十八条所称利息，应当按照税款所属纳税年度中国人民银行公布的与补税期间同期的人民币贷款基准利率加5个百分点计算。
企业依照企业所得税法第四十三条和本条例的规定提供有关资料的，可以只按前款规定的人民币贷款基准利率计算利息。
中华人民共和国企业所得税法实施条例（2019修订）： 第五章 源泉扣缴 第一百零五条 企业所得税法第三十七条所称支付，包括现金支付、汇拨支付、转账支付和权益兑价支付等货币支付和非货币支付。
企业所得税法第三十七条所称到期应支付的款项，是指支付人按照权责发生制原则应当计入相关成本、费用的应付款项。
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