网上不可以办理港澳通行证。
办理港澳通行证的流程是:申请人到受理窗口咨询、领取并填写申请表;去指定的数码照相点拍照;到受理窗口取号排队;申请人到受理窗交验材料并领取回执单;申请人到办理窗口凭回执单打印缴费收据;申请人凭缴费收据到银行缴费;申请人凭银行收费单据和回执单到受理窗口领证。
法律依据:
《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》
第十二条
经批准前往香港、澳门定居的内地公民,由公安机关出入境管理部门发给前往港澳通行证。持证人应当在前往香港、澳门之前,到所在地公安派出所注销户口,并在规定的时间内前往香港、澳门。
经批准短期前往香港、澳门的内地公民,发给往来港澳通行证。持证人应当在规定时间内前往并按期返回。