去日本需要的手续和证件是:护照和签证。中国公民出境入境，应当依法申请办理护照或者其他旅行证件。中国公民前往其他国家或者地区，还需要取得前往国签证或者其他入境许可证明。
办理签证的流程：
1.递交有效的护照。
2.递交与申请事由相关的各种证件，例如有关自己出生、婚姻状况、学历、工作经历等的证明。
3.填写并递交签证申请表格。签证不同，表格也不同，多数要用外文填写、同时提供本人照片。
4.前往国驻该国大使馆或领事馆官员会见。有的国家规定，凡移民申请者必须面谈后，才能决定;也有的国家规定，申请非移民签证也必须面谈。
5.大使馆或者领事馆，将填妥的各种签证申请表格和必要的证明材料，呈报国内主管部属门审查批准。有少数国家的使领馆有权直接发给签证，但仍须转报国内备案。
6.前往国家的主管部门进行必要的审核后，将审批意见通知驻该国使领馆。如果同意，即发给签证。如果拒绝，也会通知申请者。(对于拒签，使领馆方面也是不退签证费的)
7.缴纳签证费用。一般来说，递交签证申请的时候就要先缴纳费用，也有个别国家是签证申请成功的时候才收取费用。一般而言，移民签证费用略高，非移民签证费用略低。也有些国家和地区的签证是免费的。
办理护照的流程是：
1、公民携带本人的居民身份证、户口簿、近期免冠照片以及申请事由的相关材料；
2、向公安机关出入境管理机构提出申请；
3、公安机关出入境管理机构应当自收到申请材料之日起十五日内签发普通护照。
法律依据：《中华人民共和国出境入境管理法》 第九条
中国公民出境入境，应当依法申请办理护照或者其他旅行证件。
中国公民前往其他国家或者地区，还需要取得前往国签证或者其他入境许可证明。但是，中国政府与其他国家政府签订互免签证协议或者公安部、外交部另有规定的除外。
中国公民以海员身份出境入境和在国外船舶上从事工作的，应当依法申请办理海员证。
