法律分析：一、自离会扣多少工资
因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
劳动者没有提前30天提出离职，用人单位也不存在《劳动合同法》38条的情况，未直接提交辞职信就走人，这个时候就是劳动者违法。用人单位应该全额支付劳动者工资，但是该劳动者给用人单位造成的直接经济损失、招聘产生的费用，用人单位可以要求劳动者承担。而至于扣减工资，一般不能超过20%，或扣减后所剩工资不得低于最低工资标准。
二、哪些情况下单位可以辞退员工
劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
1、在试用期间被证明不符合录用条件的;
2、严重违反用人单位的规章制度的;
3、严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的;
4、劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的;
综上所述，员工没有提前告知单位就自动离职的，会给单位造成一定损失，影响人员管理，这样单位扣工资也是合情合理。当然，扣工资不能全部扣留，原则上不超过当月工资的百分之二十。如果双方签订竞业限制条款，员工还应该承担违约责任。
三、用人单位克扣工资怎么办
1、协商进行解决。
劳动者与用人单位就劳动纠纷问题直接进行协商，这不是必经程序，双方可以协商，也可以不协商，完全出于自愿。
2、申请进行调解。
当事人就已发生的劳动纠纷向劳动纠纷调解委员会申请其调解程序。
调解程序也由当事人进行自愿的一个选择，调解协议不具有其强制的执行力，如果双方当中有一方反悔了，那么同样的也可以向仲裁机构去申请仲裁处理。
3、仲裁处理。
当事人将纠纷提交劳动争议仲裁委员会进行处理的程序，如果想提起诉讼打劳动官司，必须经过仲裁程序，不能直接向人民法院起诉。
4、诉讼解决。
即我们平常所说的打官司。诉讼程序的启动条件是由不服劳动争议仲裁委员会裁决的一方当事人向人民法院提起诉讼后启动的程序。
法律依据：《劳动合同法》第37条：“劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同;劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。预告辞职”
