实践中对停产停业损失补偿方式具体分为以下几种：1、以被征收房屋的总体价值的一定比例计算。2、按房屋面积计算。3、根据经营收入、利润等指标确定。4、按照营业年限计算。5、由评估机构进行评估。6、据实补偿，协商确定。
一、停产停业损失补偿标准是什么
停产停业损失的补偿范围一般限于直接经济损失，具体包括被征收人的利润损失和因搬迁产生的费用，对间接损失和其他费用则不予赔偿。
企业的利润以其提供的税务部门核准的纳税证明为依据，兼顾同业同类生产经营行业市场收益情况予以确认。
注意：企业的利润既有生产经营产生的利润，也有投资产生的利润，投资产生的利润通常不受停产停业的影响。因此，停产停业利润损失一般是指企业主营业务的利润损失。
对因征收房屋造成停产停业损失的补偿，根据房屋被征收前的效益、停产停业期限等因素确定；具体补偿标准由省、自治区、直辖市制定。
据此，法律只是列举了两种考量因素，而将制定具体补偿标准的权利赋予了地方，因而实践中由于地域差别以及实际情况的不同，具体补偿标准也不一致。
例如：根据房屋面积计算，根据经营收入、利润等因素计算，根据被征收房屋的总体价值的一定比例计算，由被拆迁人提供相关材料证明停产停业损失的数额，并与拆迁人协商确定，由双方委托的评估机构依法评估来确定等，具体计算方法要视各地的规定而定。
二、营业损失补偿如何计算
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条
作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
（一）被征收房屋价值的补偿；
（二）因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；
（三）因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。
第十八条征收个人住宅，被征收人符合住房保障条件的，作出房屋征收决定的市、县级人民政府应当优先给予住房保障。具体办法由省、自治区、直辖市制定。
根据该规定，只对非住宅房屋停产停业的损失给予适当补偿。实践中，各地方对停产停业损失的计算标准有所不同，概括起来主要有以下几种：
一是以被拆迁房屋总价值的一定比例计算。例如，《巢湖市城市房屋拆迁搬迁补助费、临时安置补助费、停产停业补偿费标准》规定，拆迁非住宅房屋，在产权调换的条件下，按照非住宅房拆迁货币补偿单价的4．5％v按月计算停产停业损失。《南京市征地房屋拆迁补偿安置办法》规定，对非住宅房屋分为营业用房和非营业用房。营业用房，是指服务对象接受服务，直接用于商业活动的房屋，包括金融、娱乐、餐饮、服务等类型的房屋。非营业用房，是指除营业用房以外的其他类型的房屋，包括工厂、战场码头、仓库堆栈、办公、学校、医院、福利院、公共设施用房等。拆迁非住宅房屋造成停业的，属于营业用房的，拆迁实拖单位应当给予不超过拆迁补偿款8％的补偿；属于非营业用房的，应当给予不超过货币补偿金额5％的补偿。
二是按房屋面积计算。《北京市城市房屋拆迁补助费有关规定》第三十三条规定，因拆迁非住宅房屋造成停产、停业经济损失的，对被拆迁人根据被拆迁房屋的区位、使用性质，按照每平方米建筑面积500元至1500元给予一次性停产停业综合补助费。
三是根据经营收入、利润等指标计算。《海南省实施细则》第十二条规定，生产企业拆迁造成停产停业的损失，以拆迁公告发布前一年月平均利润额按月予以补偿。补偿期限最长不得超过十八个月。利润的计算以税务部门核准的纳税申报为准。商业用房拆迁根据以税收为准的营业额给予补偿；补偿最高限额每月不超过停业前三个月平均营业额的8％。《东莞市城市房屋拆迁搬迁补助费、临时安置补助费标准和因拆迁非住宅房屋造成停产停业的补偿标准》规定，拆迁非住宅房屋造成停产停业的补偿标准因拆迁非住宅房屋造成停产停业从而引起经济损失的，可由拆迁人按照房屋拆迁公告发布前6个月，由税务部门核发的税后平均利润（每月）80％的标准给予补偿，补偿期限为半年。
四是协商确定，或者评估计算。根据《惠州市惠城区城市房屋拆迁搬迁补助，临时安置补助和非住宅房屋停产停业补偿规定》，拆迁非住宅房屋（包括依法将原住宅房屋改为经营性房屋）造成停产、停业损失的补偿，由拆迁当事人协商解决；协商不成的，可委托有资质的中介机构进行评估，并按评估结果进行补偿。
在当代社会，我们国家对于不同房屋的类型进行拆迁的时候，所进行的一系列的计算补偿费用方式也是不一样的，比如说营业性的用房和住宅类型的用房就会存在着差异，营业性用房显著会提高补偿的额度，毕竟它存在着一个拆迁导致的营业损失。
三、关于商业用地拆迁补偿的规定有哪些
1、房子的价值补偿标准，这里的房屋补偿，指的是对被征收的国有土地上建筑价值进行的补偿，按不低于房子征收决定公告之日被征收房子类似的市场价格，然后请具有评估资质的评估机构对其确定评估，制定出相应房屋市场价格表供当地被拆迁的居民进行参考。2、搬迁费和临时安置费用，具体数额各市一般都已确定具体数额及计算方式，详见各地出具标准，在这里作者所列算的补偿标准，是以大众化被拆迁人自主搬迁和过渡方式进行的计算。如果拆迁人提供周转房，则无需支付临时安置费。3、停产停业损失的补偿，该费用针对非住宅类房屋运营性房屋进行补偿，因为属个案，补偿标准不能统一，一般是有征收当事人进行协商确定，协商不成的，可委托房地产价格评估机构评估确定。
【本文关联的相关法律依据】
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第八条为了保障国家安全、促进国民经济和社会发展等公共利益的需要，有下列情形之一，确需要征收房屋的，由市、县级人民政府作出房屋征收决定：
（一）国防和外交的需要；
（二）由政府组织实施的能源、交通、水利等基础设施建设的需要；
（三）由政府组织实施的科技、教育、文化、卫生、体育、环境和资源保护、防灾减灾、文物保护、社会福利、市政公用等公共事业的需要；
（四）由政府组织实施的保障性安居工程建设的需要；
（五）由政府依照城乡规划法有关规定组织实施的对危房集中、基础设施落后等地段进行旧城区改建的需要；
（六）法律、行政法规规定的其他公共利益的需要。