律师解答：
1、行政级别不同
市代建局属于市政府直属事业单位。
建设局则是国务院组成部门，市建设局是市一级主管建设行业的行政部门。
2、职责范围不同
市代建局负责市内非经营性代建项目的组织和协调管理工作。
市建设局则要负责保障城镇低收入家庭住房、推进住房制度改革、规范住房和城乡建设管理秩序、监督管理建筑市场、研究拟订城市建设的政策、规划并指导实施，指导城市市政公用设施建设、安全和应急管理等工作。
开发商与建设局有业务往来。
3、内设机构不同
代建局主要包括办公室、计划财务科、项目建设管理科。
建设局主要包括办公厅、法规司、住房改革与发展司、住房保障司、城乡规划司、标准定额司、房地产市场监管司、建筑市场监管司、城市建设司、村镇建设司、工程质量安全监管司等部门。
【法律依据】：
《政府投资项目代建制管理办法》 第十九条 代建单位完成建设管理，工期提前且质量优良的，项目法人按财政部发布的《基本建设财务管理若干规定》的有关规定在合同中约定奖励额度；超出工期、概算或质量不合格的，按合同约定承担违约责任。
工程质量不合格的，代建单位应当督促施工单位及时返工，直至合格为止，由此增加的费用由代建单位承担；发生严重质量事故的，项目法人应当解除与代建单位订立的合同，并要求其承担相应的法律责任。
