律师分析：
有房产证没有契税发票是合法的，契税发票可以到税务机关进行补办。可以拿上房产证让税务部门出具相应的证明，也可以到市房屋产权登记发证中心档案部门调出档案，复印后，就可以过户了。如果上述部门提供不了，需补交，有当年的购房发票的话，按当年的评估价缴纳契税，如果没有，则需要按现在的评估价缴纳。购房契税，指房屋所有权发生变更时，就当事人所订契约按房价的一定比例向新业主(产权承受人)征收的一次性税收。它是对房地产产权变动征收的一种专门税种。纳税人应当自纳税义务发生之日起10日内，向契税征收机关办理纳税申报，并在契税征收机关核定的期限内缴纳税款。
【法律依据】：
《中华人民共和国契税法》
第一条 在中华人民共和国境内转移土地、房屋权属，承受的单位和个人为契税的纳税人，应当依照本法规定缴纳契税。
第二条 本法所称转移土地、房屋权属，是指下列行为：
（一）土地使用权出让；
（二）土地使用权转让，包括出售、赠与、互换；
（三）房屋买卖、赠与、互换。
前款第二项土地使用权转让，不包括土地承包经营权和土地经营权的转移。
以作价投资（入股）、偿还债务、划转、奖励等方式转移土地、房屋权属的，应当依照本法规定征收契税。
第三条 契税税率为百分之三至百分之五。
契税的具体适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的税率幅度内提出，报同级人民代表大会常务委员会决定，并报全国人民代表大会常务委员会和国务院备案。
省、自治区、直辖市可以依照前款规定的程序对不同主体、不同地区、不同类型的住房的权属转移确定差别税率。
