学校用地土地使用税一般是不用缴纳的，对于国家起办的教育等用地设施是可以免征税收的。而其他的应当按照法律规定的土地管理条例来缴纳土地使用税，而土地使用税的计算会根据土地面积来进行确定。
一、学校用地土地使用税要缴纳吗
对国家拨付事业经费和企业办的各类学校、托儿所、幼儿园自用的房产、土地，免征房产税、城镇土地使用税.
答:城镇土地使用税采用定额税率，即采用有幅度的差别税额，按大、中、小城市和县城、建制镇、工矿区分别规定每平方米土地使用税年应纳税额.具体标准如下:
(一)大城市1.5元至30元;
(二)中等城市1.2元至24元;
(三)小城市0.9元至18元;
(四)县城、建制镇、工矿区0.6元至12元.
大、中、小城市以公安部门登记在册的非农业正式户口人数为依据，按照国务院颁布的《城市规划条例》中规定的标准划分.人口在50万以上者为大城市;人口在20万至50万之间者为中等城市;人口在20万以下者为小城市.
1、房产税:
《房产税暂行条例》(国发[1986]90号)第五条第二规定，由国家财政部门拨付事业经费的单位自用的房产免纳房产税。
根据上述规定，免征房产税的范围包含由国家财政部门拨付事业经费的学校自用的房产，但不包括民办的学校自用的房产。
《财政部、国家税务总局关于教育税收政策的通知》(财税[2004]39号)第二条明确，对国家拨付事业经费和企业办的各类学校、托儿所、幼儿园自用的房产、土地，免征房产税、城镇土地使用税。但是考虑到《房产税暂行条例》第十条规定，本条例由财政部负责解释;施行细则由省、自治区、直辖市人民政府制定，抄送财政部备案。
根据上述规定，如果学校所在地并未出台更为明确的免征房产税的政策规定，则对于民办学历教育学校不应减免房产税。
2、城镇土地使用税:
《城镇土地使用税暂行条例》第六条规定，由国家财政部门拨付事业经费的单位自用的土地免缴土地使用税。
根据上述规定，免征土地使用税的范围包含由国家财政部门拨付事业经费的学校自用的土地，但显然也不包括民办的学校自用的土地。
除了上述财税[2004]39号，《国家税务总局关于土地使用税若干具体问题的解释和暂行规定》(国税地字[1988]15号)也有规定“企业办的学校、医院、托儿所、幼儿园，其用地能与企业其他用地明确区分的，可以比照由国家财政部门拨付事业经费的单位自用的土地，免征土地使用税。”另外考虑到《城镇土地使用税暂行条例》第十三条的规定“本条例的实施办法由省、自治区、直辖市人民政府制定。”
因而，如果学校所在地并未出台更为明确的免征土地使用税的政策规定，则对于民办学历教育学校不应减免土地使用税。如《辽宁省地方税务局关于明确房产税、城镇土地使用税有关问题的通知》(辽地税函[2009]189号)规定，对经教育部门批准，从事学历教育的全日制民办学校自用的房产和土地，暂免征收房产税和城镇土地使用税。
综上所述，学校用地土地使用税一般是不用缴纳的，或者国家免征税范围内的企业，都是可以免征房产、土地使用税等，而其他城市或者工矿区等范围内使用土地的都应当缴纳相应的土地使用税。
