法律分析：(一)协商方式
第一种方式是通过协商处理纠纷，即专利权人与侵权人通过协商解决问题。这种方式是专利权人在侵权行为已经发生并取得一定证据的前提下，解决纠纷的有效方式。从处理结果方面来看，利用这种方式解决专利纠纷问题的最终结果大致可以分为三种：第一种是侵权人主动停止侵权行为，同时主动赔偿专利权人经济损失。第二种是纠纷双方自愿签订专利使用许可协议书，让侵权行为具有合法性。第三种是纠纷双方协商失败，只能通过其他方式处理纠纷。
(二)向专利管理机关提出纠纷处理申请
专利权人还可以向专利管理部门提出纠纷仲裁申请。这种方式主要用于纠纷双方协商无果之后，纠纷双方其中一方或者双方对于协商结果都不认可，或者对于协商协议书中的某些细节无法达成一致。在这种情况下就可以向专利管理部门提出纠纷处理申请，通过第三方机构的介入解决纠纷。其具有很强的专业性以及公信力，可以在保持客观、公允的基础上，制定出符合纠纷双方利益需求的处理意见，作为中间人出现，对于专利侵权纠纷进行调解。其有权命令侵权人立刻停止当前的侵权行为，培养专利人经济损失，若其不认可处理意见，可以在收到处理结果后3日内向当地人民法院发出诉讼申请，若3日期满即不发出诉讼申请又拒不执行处理方案，专利管理部门有权请求法院对其进行强制执行。
(三)向当地人民法院提起诉讼
从专利权人角度出发，在得知某人侵犯了自己的专利权后，可以根据实际情况灵活选择处理方式，既可以向专利管理部门提出纠纷处理申请，也能直接去人民法院进行起诉。如果其决定向人民法院提起诉讼，需要注意人民法院的管辖权问题，并不是任意一级人民法院都可以处理专利权纠纷案件。在正式发起诉讼之前要确定人民法院的管辖权范围。在绝大多数地区，专利纠纷案件一般交由人民法院知识产权审判庭或是经济审判庭负责审理。
