股权变更印花税的税率是按照股权转让价格的万分之五来征收的。其中，专利权转让、专利实施许可所书立的合同、书据，适用产权转移书据税目，按所载金额万分之五贴花；专利申请权转让、非专利技术转让所书立的合同，适用技术合同税目，按所载金额万分之三贴花。
股权变更应注意哪些事项：
（一）签订股权变更协议的主体
在股权变更中，出让股权的主体应当是公司的股东，受让方可以是原公司的股东，也可以是股东外的第三人。在实践中，一些公司股东是以公司名义签订的股权 转让协议，这会造成签约主体的混淆。另外，如果受让方是公司，要考虑是否需要经过股东会决议通过;如果是自然人，则要审查其是否已注册过一人有限公司。
（二）股东会或其他股东的决议或意见
股东在对外转让股权签订股权变更协议前要征求其他股东意见，其他股东在同等条件下，放弃优先购买权时，才能向股东外第三人转让。同时，还需注意其它法 定前置程序的履行，否则会出现无效的法律后果。另外，无论是开股东会决议还是单个股东的意见，均要形成书面材料，以避免其他股东事后反悔，导致纠纷产生。
（三）对前置审批程序的关注
一些股权变更协议还要涉及到主管部门的批准，如国有股权、或外资企业股权变更等。
（四）明晰股权结构
股权变更协议受让方应当通过审阅转让股权的股东所在公司的公司章程、营业执照、税务登记证、董事会决议、股东会决议等必要的文件，对转让股权的股东所在公司的股权结构作详尽了解。
（五）股权变更协议受让人应认真分析受让股权所在公司的经营状况及财务状况。
现行印花税的比例税率分为以下五档：
1、财产保险合同、财产租赁合同、仓储合同、保管合同的税率为1%；
2、购销（买卖）合同、建筑安装工程承包合同、技术合同的税率为0.3%；
3、加工承揽合同、建设工程勘察设计合同、货物运输合同、产权转移书据和记载金额的账簿的税率为0.5%；
4、借款合同的税率为0.05%；
5、对股票买卖、继承、赠与所书立的A股、B股股权转让书据，只对转让方单边征收税率为1%的证券交易印花税，对受让方则不征收。
法律依据：
《中华人民共和国印花税暂行条例》第三条
纳税人根据应纳税凭证的性质，分别按比例税率或者按件定额计算应纳税额。具体税率、税额的确定，依照本条例所附《印花税税目税率表》执行。
应纳税额不足1角的，免纳印花税。
应纳税额在1角以上的，其税额尾数不满5分的不计，满5分的按1角计算缴纳。
