疫情期间值班工资是正常发放的，但涉及到从事疫情防护工作的医务人员或者其它工作者在获得工资待遇的情况，还可以获得一定的补助的，具体情况可以根据用人单位的相关规定来进行处理。
疫情期间值班工资是按照工资待遇发放的，但从事疫情防控工作的医务人员才有补助，临时性工作补助标准为:直接接触病例的每人每天 300 元，参加疫情防控的其他医务人员和防疫工作者每人每天 200 元。《中华人民共和国传染病防治法》第六十四条:“对从事传染病预防、医疗、科研、教学、现场处理疫情的人员，以及在生产、工作中接触传染病病原体的其他人员，有关单位应当按照国家规定，采取有效的卫生防护措施和医疗保健措施，并给予适当的津贴。”
按照《人力资源社会保障部 财政部关于建立传染病疫情防治人员临时性工作补助的通知》(人社部规〔2016〕4号)的规定，对于直接接触待排查病例或确诊病例，诊断、治疗、护理、医院感染控制、病例标本采集和病原检测等工作相关人员，按照每人每天 300 元予以补助;对于参加疫情防控的其他医务人员和防疫工作者，按照每人每天 200 元予以补助。当日工作时间累积超过4小时的，按照一天计算;在4小时以下的，按照半天计算。
二、员工的工资待遇标准
根据《人力资源社会保障部办公厅关于妥善处理新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控期间劳动关系问题的通知》的相关规定:企业因受疫情影响导致生产经营困难的，可以通过与职工协商一致采取调整薪酬、轮岗轮休、缩短工时等方式稳定工作岗位，尽量不裁员或者少裁员。符合条件的企业，可按规定享受稳岗补贴。企业停工停产在一个工资支付周期内的，企业应按劳动合同规定的标准支付职工工资。超过一个工资支付周期的，若职工提供了正常劳动，企业支付给职工的工资不得低于当地最低工资标准。职工没有提供正常劳动的，企业应当发放生活费，生活费标准按各省、自治区、直辖市规定的办法执行。
疫情期间一般的值班人员显然是需要发放工资待遇的，但法律上也明确了对于从事疫情防护工作的医疗工作者以及其它的防控人员可以根据不同的身份给补助，用人单位在发放工资待遇或者相关补助时，可以按照规定来进行合法的处理。
