法律分析：1、三甲医院可以开增值税发票。
2、为加强增值税征收管理，规范增值税专用发票使用行为，增值税专用发票开票增值税专用发票开票根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及其实施细则和《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则，制定本规定。折叠第二条一般纳税人有下列情形之一者，不得领购使用专用发票：
（一）会计核算不健全，即不能按会计制度和税务机关的要求准确核算增值税的销项税额、进项税额和应纳税额者。
（二）不能向税务机关准确提供增值税销项税额、进项税额、应纳税额数据及其他有关增值税税务资料者。上述其他有关增值税税务资料的内容，由国家税务总局直属分局确定。
（三）有以下行为，经税务机关责令限期改正而仍未改正者：1.私自印制专用发票；2.向个人或税务机关以外的单位买取专用发票；3.借用他人专用发票；4.向他人提供专用发票；5.未按本规定第五条的要求开具专用发票；6.未按规定保管专用发票；7.未按本规定第十六条的规定申报专用发票的购、用、存情况；8.未按规定接受税务机关检查。（四）销售的货物全部属于免税项目者。有上列情形的一般纳税人如已领购使用专用发票，税务机关应收缴其结存的专用发票。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则，制定本规定。折叠第二条一般纳税人有下列情形之一者，不得领购使用专用发票：（一）会计核算不健全，即不能按会计制度和税务机关的要求准确核算增值税的销项税额、进项税额和应纳税额者。（二）不能向税务机关准确提供增值税销项税额、进项税额、应纳税额数据及其他有关增值税税务资料者。上述其他有关增值税税务资料的内容，由国家税务总局直属分局确定。（三）有以下行为，经税务机关责令限期改正而仍未改正者：1.私自印制专用发票；2.向个人或税务机关以外的单位买取专用发票；3.借用他人专用发票；4.向他人提供专用发票；5.未按本规定第五条的要求开具专用发票；6.未按规定保管专用发票；7.未按本规定第十六条的规定申报专用发票的购、用、存情况；8.未按规定接受税务机关检查。（四）销售的货物全部属于免税项目者。有上列情形的一般纳税人如已领购使用专用发票，税务机关应收缴其结存的专用发票。
