《中国共产党纪律处分条例》只对预备党员违纪行为作出了原则性规定，实践中还有较多适用上的误区。严格按照党章和党内法规规定的标准发展党员，是党的建设中一项经常性的重要工作，也是保持党的先进性和纯洁性的重要保证。
(一)对预备党员可以立案审查
预备党员的预备期是正式入党前接受党组织认真教育和考察的重要阶段。预备党员虽不属于正式党员，但所应遵守的义务同正式党员一样，所享有的权利，除没有表决权、选举权和被选举权外，也同正式党员一样。党组织发现预备党员有违纪行为需要追究党纪责任的，可以按照执纪审查相关规定进行立案审查。
因此，发现预备党员在预备期发生违纪行为，相关党组织和纪委应该依据监督执纪工作规则等规定的初核、立案、审查、审理等程序进行纪律审查。
违纪事实材料必须与被审查的预备党员见面；对被审查的预备党员的申辩应当认真听取并如实记录，采纳其提出的合理意见；违纪的预备党员对组织处理不服的，有权向本人所在党组织、上级党组织直至中央提出申诉。
(二)处理预备党员的方式不是党纪处分
给予发生违纪行为的预备党员的处理方式包括批评教育、延长预备期和取消预备党员资格，而不能适用党内警告直至开除党籍等党纪处分。
《中国共产党纪律处分条例》第三十四条
预备党员违犯党纪，情节较轻，可以保留预备党员资格的，党组织应当对其批评教育或者延长预备期；情节较重的，应当取消其预备党员资格。
法律依据
《中国共产党纪律处分条例》第三十四条
预备党员违犯党纪的处分方式包括：
1．批评教育，适用于情节较轻的违纪行为，可以保留其预备党员资格，且不需要延长预备党员预备期的情况。
2．延长预备期，同样适用于情节较轻的违纪行为，可以保留预备党员资格，但仅给予批评教育无法达到惩戒效果的情况。党组织应该通过延长预备期的方式继续对其考察教育，延长预备期不能超过一年。
3．取消预备党员资格，适用于违纪情节较重的预备党员。根据党章的规定，预备党员不履行党员义务，不具备党员条件的，应当取消其预备党员资格。因此，此处情节较重应当理解为该违纪行为直接导致违纪的预备党员丧失成为党员的基本条件。
