建设工程合同纠纷处理流程如下:1、严格招投标和承发包程序,优选施工单位,严格控制工程分包和转包。2、建设前期加强立项管理,打足投资,保证归口使用资金80%以上存入银行,专款专用。3、加强合同和信息管理,签定协议尽量采用规范的合同示范文本,对附加条款要仔细推敲,咨询有关专家,请专家给予指导。4、严格进行工程变更把关,严禁通过设计变更扩大建设规模,增加工程内容,提高建设标准,对必须变更的,应先做工程量和造价增减分析。等等。
【本文关联的相关法律依据】
根据《中华人民共和国民法典》第七百九十八条
隐蔽工程在隐蔽以前,承包人应当通知发包人检查。发包人没有及时检查的,承包人可以顺延工程日期,并有权请求赔偿停工、窝工等损失。