农村合作医疗不能补交。农村合作医疗每年缴纳时间为每年的11月份到12月份尾，生效时间为次年的1月1日，也就是说农民参加合作医疗必须在每年11-12月参保，次年补交只能在下一年才能生效。
农村合作医疗报销比例
一、乡(镇)卫生院医疗费报销比例
1、300元以下的，报销30%;
2、300元(不含)以上2000元以下的，报销70%;
3、2000元(不含)以上的，报销50%。
二、县级定点医疗机构医疗费报销比例
1、500元以下的，报销25%;
2、500元(不含)以上10000元以下的，报销65%;
3、10000元(不含)以上的，报销50%。
三、二级医院医疗费报销比例
1、500元以下的，报销25%;
2、500元(不含)以上10000元以下的，报销55%;
3、10000元(不含)以上的，报销50%。
四、三级医院医疗费报销比例
1、1000元以下的，报销20%;
2、1000元(不含)以上10000元以下的，报销45%;
3、10000元以上(不含)的，报销40%。
农村合作医疗报销时间
当年发生的医疗费原则上在次年的1月底前必须结清。
农村合作医疗报销标准
一、门诊报销标准
1、村卫生室及村中心卫生室就诊报销60%，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。
2、镇卫生院就诊报销40%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。
3、二级医院就诊报销30%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
4、三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。
5、中药发票附上处方每贴限额1元。
6、镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。
二、住院报销标准
1、药费：辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费限额200元;手术费(参照国家标准，超过1000元的按1000元报销)。
2、60周岁以上老人在镇卫生院住院，治疗费和护理费每天补偿10元，限额200元。
三、大病报销标准
1、镇风险基金补偿：凡参加农村合作医疗保险的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%。
2、镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗补偿年限额1.1万元。
