什么时候案件会被指定管辖
有管辖权的人民法院由于特殊原因，不能行使管辖权的，由上级人民法院指定管辖。人民法院之间因管辖权发生争议，由争议双方协商解决;协商解决不了的，报请它们的共同上级人民法院指定管辖。
刑事案件管辖权异议问题
刑事诉讼是国家机关或自诉人对被告人的犯罪行为进行追诉的活动，案件管辖尤其是级别管辖与被告人联系最为密切，对管辖权异议的要求也最为强烈，故犯罪嫌疑人、被告人应当首先享有管辖异议权。被害人也是刑事诉讼当事人之一，也有权对刑事诉讼提出管辖权异议。
刑事案件立案管辖权规定
刑事案件立案管辖权规定如下：刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。人民检察院在对诉讼活动实行法律监督中发现的司法工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、非法搜查等侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪，可以由人民检察院立案侦查。对于公安机关管辖的国家机关工作人员利用职权实施的重大犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。自诉案件，由人民法院直接受理。
相关法律规定
《中华人民共和国刑事诉讼法》第十九条,刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。
刑事案件什么法院管辖
基层人民法院管辖第一审普通刑事案件，但是依照本法由上级人民法院管辖的除外。中级人民法院管辖下列第一审刑事案件：(一)危害国家安全、恐怖活动案件;(二)可能判处无期徒刑、死刑的案件。高级人民法院管辖的第一审刑事案件，是全省(自治区、直辖市)性的重大刑事案件。最高人民法院管辖的第一审刑事案件，是全国性的重大刑事案件。
刑事案件立案管辖权规定
刑事案件立案管辖权规定如下：刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。人民检察院在对诉讼活动实行法律监督中发现的司法工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、非法搜查等侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪，可以由人民检察院立案侦查。对于公安机关管辖的国家机关工作人员利用职权实施的重大犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。自诉案件，由人民法院直接受理。
《中华人民共和国民事诉讼法》第三十七条
