1、公司章程规定股东以货币之外的实物出资，尤其是土地房屋或其它办理产权过户的实物，股东没办理过户手续或没有交付实物。
2、约定是以货币出资，但股东要求以实物出资。
3、约定是以特定物出资如土地使用权、房产等，但股东要求替代出资。
4、作为出资的实物或其他非货币财产的价格明显不足。
5、交付的标的物不符合章程约定或国家规定的品质标准，不具有应有的功能或效用。
6、交付的标的物存在着第三人的合法权利，影响公司对标的物的占有、使用和处分。
股东出资瑕疵的情形有哪些
一是出资时间上的瑕疵，即期限届满仍未能缴纳全部出资额;
另一类是出资财产上的瑕疵，例如以不动产、知识产权等非货币财产出资，但该权利存有瑕疵，或是未变更登记至公司名下等。
股东在瑕疵出资时的补偿责任
对于有限责任公司，股权的数额是指出质人(公司股东)在公司登记机关登记的出资额，或者公司章程记载、公司签发的出资证明书记载的出资额。
对于股份有限公司，由于其资本划分为等额股份，股权的数额是指公司章程记载、股东名册记载的出质人(公司股东)认购的公司股份数，或者出质人(公司股东)持有的公司股票代表的股份数；
一般以“万股”计算。根据出质人持有的公司股权情况，以及债权担保的需要，出质人、质权人可以协商确定出质股权的数额，并在质权合同中予以明确。
办理股权出质登记时，即以质权合同中载明的事项以及有关股权证明为依据，确定出质股权的数额。
出资瑕疵情况下股东资格如何认定？
对于有限责任公司，股权的数额是指出质人(公司股东)在公司登记机关登记的出资额，或者公司章程记载、公司签发的出资证明书记载的出资额。对于股份有限公司，由于其资本划分为等额股份，股权的数额是指公司章程记载、股东名册记载的出质人(公司股东)认购的公司股份数，或者出质人(公司股东)持有的公司股票代表的股份数，一般以“万股”计算。根据出质人持有的公司股权情况，以及债权担保的需要，出质人、质权人可以协商确定出质股权的数额，并在质权合同中予以明确。办理股权出质登记时，即以质权合同中载明的事项以及有关股权证明为依据，确定出质股权的数额。
公司可否对瑕疵出资的股东的权利进行限制
公司可以对瑕疵出资的股东的权利进行限制。
我国股东以土地使用权作为出资税费包括哪些
以土地使用权投资需要缴纳企业所得税、印花税。契税由产权承受方缴纳。
