1、关押吸毒人员强制执行戒毒期限不同
司法强制戒毒所被强制执行戒毒的，期限为两年，自作出强制隔离戒毒决定之日起计算。而公安强制戒毒一般是3到6个月。
2、执行吸毒人员强制戒毒时间不同
被抓吸毒人员一般先送公安机关强戒，然后送司法机关强戒并执行具体强戒期限。
3、主管部门不同
公安强制戒毒所是公安机关主管的强制隔离戒毒所，司法强制戒毒所是司法行政机关主管的强制隔离戒毒所。
中国的戒毒所分为三类：
第一类是公安机关主管的强制隔离戒毒所。
第二类是司法行政机关主管的强制隔离戒毒。
第三类是戒毒医疗机构，由卫生部门主管。
按规定,被强制隔离戒毒的人员在公安机关的强制隔离戒毒场所执行强制隔离戒毒3个月至6个月后，最长不超过12个月。转至司法行政部门的强制隔离戒毒场所继续执行强制隔离戒毒。
中国通过强制戒毒办法，设立了至少是七百所以上强制戒毒所，每年能够强制收戒30-40万人，那么还有一部分，劳教戒毒所大约有100所左右，每年也能收戒10万人。
那么这样总数加起来，就是每年收戒也就是50万人左右，但现在的实际吸毒人数起码是500万以上，强制戒毒所或者劳教戒毒所这种封闭环境下的戒毒只能解决10%左右，相当多的人只能想一些其他的各种各样的戒毒办法。
扩展资料戒毒所的设置：
强制戒毒所的设置，由县级以上人民政府公安机关根据省、自治区、直辖市人民政府的统一规划，提出方案，报请同级人民政府批准后，报公安部备案。
铁道、交通、民航系统相当于县级以上的公安机关需要设置强制戒毒所时，应当分别报请铁道部公安局、交通部公安局、民航总局公安局批准后，报公安部备案。 公安机关不得与任何单位、个人合资开办强制戒毒所。
强制戒毒所必须单独设置，床位不少于60张。 强制戒毒所选址应当尽量远离机关、学校、居民区、托幼园所及其他人群密集的繁华区域，远离环境嘈杂、污染的地方。
法律依据：《司法行政机关强制隔离戒毒工作规定》第五十八条 强制隔离戒毒所应当按照有关规定对戒毒人员进行诊断评估。对强制隔离戒毒期限届满且经诊断评估达到规定标准的戒毒人员，应当解除强制隔离戒毒。经诊断评估，对符合规定条件的戒毒人员，强制隔离戒毒所可以提出提前解除强制隔离戒毒的意见或者延长强制隔离戒毒期限的意见，并按规定程序报强制隔离戒毒决定机关批准。强制隔离戒毒所收到强制隔离戒毒决定机关出具的提前解除强制隔离戒毒决定书或者延长强制隔离戒毒期限决定书的，应当及时送达戒毒人员。
