1、结算工程款时公司扣了百分之五的钱，可以先协商。2、协商不成可以书写起诉状或仲裁申请书、准备好施工合同等证据向仲裁机构申请仲裁或者向人民法院提起民事诉讼，主张要求支付剩余5%。3、起诉的同时最好申请财产保全，查封账户和其他财产；胜诉之后，如果对方在履行期未履行法院判决，可以申请法院强制执行。风险提示：工程款被恶意拖欠的相关注意事项：一是交涉、要回要及时。交涉、要回的方法很多，口头的、书面的都可以，尤其是在通信、交通日益发达的今天，及时交涉、要回，就有机会早日解决问题，就能减少施工企业可能遭受的损失，而且还有利于继续履行合同;二是收集证据要及时。
工程款结算请求权会有时效
根据《民法典》的相关规定，工程款结算请求权有时效期限，适用三年的普通诉讼时效期间。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护;有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。风险提示：拖欠工程款怎么办：当遇到拖欠工程款时，首先协商解决，协商不成建议尽快向法院起诉要求还款，一旦超过了三年的诉讼时效，就可能会丧失胜诉权，胜诉之后，如果对方在履行期未履行法院判决，可以申请法院强制执行。
工程款结算是否有时效
1、工程款结算有诉讼时效，我国法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。2、但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护;有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。风险提示：单位追讨工程款注意事项包括：1、收集当事人诉讼主体资格的证据；2、搜集证明建设工程合同关系成立的证据；3、注意收集能够证明建设工程合同履行情况的证据；4、因建设单位拖欠工程款，施工单位在起诉时可依据建设工程施工合同的约定要求对方承担违约金；若合同没有违约金条款，可要求对方支付一定金额的逾期付款利息。
工程款结算纠纷如何正确处理
工程款结算纠纷正确处理方式：1、双方协商。被欠款人可以主动与发包人、转包人、违法分包人等进行协商解决，争取能够达成还款协议。一些被欠款人为尽快能够拿到工程款，往往会做出较大的让步，只要不亏本甚至少亏本的情况下，都可以达成协议。2、协商不成可准备相关证据及诉讼材料向法院提起诉讼，要求判令按照约定支付工程款。起诉可以向工程所在地法院也可以向被告所在地法院起诉，起诉的同时最好申请财产保全，查封账户和其他财产；胜诉之后，如果对方在履行期未履行法院判决，可以申请法院强制执行。风险提示：从规避法律风险的角度而言，通过诉讼的方式来追讨欠款，仍然是工程欠款追讨的最佳方式。即便在诉讼的过程中，也可以通过由法官作为中间人，做欠款人的工作，同时被欠款人也作出一定程度的让步，在这种情况下，欠款双方很容易达成和解，然后签署和解协议。在一方不履行和解协议时，直接向法院申请强制执行该协议即可。
工程款结算请求权是否有时效
工程款结算请求权有时效，诉讼时效三年，我国法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护；有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。风险提示：发包人未支付工程价款的责任：发包人未按照约定支付价款的，承包人可以催告发包人在合理期限内支付价款。发包人逾期不支付的，除根据建设工程的性质不宜折价、拍卖外，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以请求人民法院将该工程依法拍卖。建设工程的价款就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。
工程款结算请求权有时效吗？
1、工程款结算请求权有时效，诉讼时效三年，我国法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。2、诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护；有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。风险提示：追讨工程欠款应注意的几个问题：一、要重视建设工程合同，明确双方的权利和义务。二、要加强基础管理工作，引入风险意识。三、要遵循人性化服务，工程欠款催缴工作要循序渐进。四、要抓住案件重点，在法庭上用事实说话。
