医保电子发票的查询方法如下：
1、首先在手机中打开支付宝，进入首页，点击“更多”，进入更多应用；
2、在更多应用界面点击便民生活中的“城市服务”，进入城市服务页面；
3、在城市服务页面将城市定位为自己的所在地，点击“医保电子凭证”；
4、在医保电子凭证页面，点击“同意协议并激活”；
5、授权激活后即可领取“医保电子凭证”，可在“卡包-证件”中查看；
6、当需要使用时进入卡包，找到“医保电子凭证”，点击立即使用即可。
医保电子凭证，由国家医保信息平台统一签发，是基于医保基础信息库为全体参保人员生成的医保身份识别电子介质。电子凭证通过实名/实人认证技术，采用加密算法形成电子标识，具备安全可靠、认证唯一等重要特点。参保人可通过电子凭证享受各类在线医疗保障服务，包括医保业务办理、医保账户查询、医保就诊和购药支付等。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》
第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。
社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
