自行车违章不会记入个人档案。
但是自行车违章也属于交通违法行为，可能会被处以警告或者5元以上50元以下罚款，缴纳罚款之后登记对于非机动车驾驶人没有太大影响。
自行车不是犯罪自然也不会留有案底。案底一般指当事人过去犯法或犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至公安部门与相关国家机关。
那么骑自行车应该遵守哪些交通规则呢？
1.驾驶自行车、三轮车必须年满12周岁；
2.驾驶电动自行车和残疾人机动轮椅车必须年满16周岁；
3.不得醉酒驾驶；
4.转弯前应当减速慢行，伸手示意，不得突然猛拐，超越前车时不得妨碍被超越的车辆行驶；
5.不得牵引、攀扶车辆或者被其他车辆牵引，不得双手离把或者手中持物；
6.不得扶身并行、互相追逐或者曲折竞驶；
7.不得在道路上骑独轮自行车或者2人以上骑行的自行车；
8.非下肢残疾的人不得驾驶残疾人机动轮椅车；
9.自行车、三轮车不得加装动力装置；
10.不得在道路上学习驾驶非机动车。
综上所述，自行车违章是不会计入个人档案的，有案底的都是违法犯罪的行为，但是违章也是会被处罚的，为了自身安全，律师建议大家依法行驶。
法律依据：
《中华人民共和国道路交通安全法》第五十七条 驾驶非机动车在道路上行驶应当遵守有关交通安全的规定。非机动车应当在非机动车道内行驶；在没有非机动车道的道路上，应当靠车行道的右侧行驶。
第五十八条 残疾人机动轮椅车、电动自行车在非机动车道内行驶时，最高时速不得超过十五公里。
第五十九条 非机动车应当在规定地点停放。未设停放地点的，非机动车停放不得妨碍其他车辆和行人通行。
第八十九条 行人、乘车人、非机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者五元以上五十元以下罚款；非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚的，可以扣留其非机动车。
