目前个税专项附加扣除主要有两种申报方式，第一种是企业、单位代扣，第二种是自行申报。
个税专项附加扣除申报方法
1、企业、单位代扣
如果是获得收入、薪金的部分需要申报个税专项附加扣除，可以提供相关信息给企业、单位，这样可以由企业单位进行代扣，这样纳税人就省却了跑腿的麻烦事。
2、自行申报
从2019年1月1日起，五险一金都有税务部门统一扣除了，这样一来自行申报就需要自己去税务局提供相关信息进行申报。
新个税的六项专项附加扣除标准分别是什么？
新个人所得税增加了6项专项附加扣除是指纳税人有发生子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或住房租金、赡养老人的支出，即可享受税费减免。
1、子女教育：纳税人的子女年满3周岁，接受全日制学历教育的相关支出，按照每个子女每月1000元的标准定额扣除。
2、继续教育：在学历教育期间按照每月400元定额扣除最长扣除时间48个月。纳税人接受技能人员职业资格继续教育、专业技术人员职业资格继续教育的支出，在取得相关证书的当年，按照3600元定额扣除。
3、大病医疗：在一个纳税年度内，纳税人发生的与基本医保相关的医药费用支出，扣除医保报销后个人负担(指医保目录范围内的自付部分)累计超过15000元的部分，根据实际超出金额扣除，最高扣除额度为80000元。
个税专项附加扣除申报
专项附加扣除办理申报流程包括两种途径，分别是由单位办理申报和个人自行申报。具体来讲（1）由单位按月发工资预扣税款时办理。除大病医疗以外，对其他五项扣除，您可以选择在单位发放工资薪金时，按月享受专项附加扣除政策。首次享受时，需要填写《个人所得税专项附加扣除信息表》并报送给任职受雇单位，单位在每个月发放工资时，像“三险一金”一样，为您办理专项附加扣除。
（2）自行在年度综合所得汇算清缴申报时办理。一般来讲，有以下情形之一的，您可以选择在次年3月1日至6月30日内，自行向汇缴地主管税务机关办理汇算清缴申报时进行专项附加扣除，税款多退少补；个人所得税专项附加扣除信息随纳税申报表一并报送：①不愿意通过单位办理扣除，未将相关专项附加扣除信息报送给任职受雇单位的；②没有工资、薪金所得，但有劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得的；③有大病医疗支出项目的；④纳税年度内未享受或未足额享受专项附加扣除等情形。
如果同时有两个以上发工资的单位，那么对同一个专项附加扣除项目，在一个纳税年度内，您只能选择从其中的一个单位办理扣除。
房贷利息专项附加扣除规则
住房贷款利息专项附加扣除标准：纳税人本人或者配偶单独或者共同使用商业银行或者住房公积金个人住房贷款为本人或者其配偶购买中国境内住房，发生的首套住房贷款利息支出，在实际发生贷款利息的年度，按照每月1000元的标准定额扣除，扣除期限最长不超过240个月。纳税人只能享受一次首套住房贷款的利息扣除。
个税专项附加扣除怎么操作
专项附加扣除办理申报流程包括两种途径，分别是由单位办理申报和个人自行申报。具体来讲（1）由单位按月发工资预扣税款时办理。除大病医疗以外，对其他五项扣除，您可以选择在单位发放工资薪金时，按月享受专项附加扣除政策。首次享受时，需要填写《个人所得税专项附加扣除信息表》并报送给任职受雇单位，单位在每个月发放工资时，像“三险一金”一样，为您办理专项附加扣除。
（2）自行在年度综合所得汇算清缴申报时办理。一般来讲，有以下情形之一的，您可以选择在次年3月1日至6月30日内，自行向汇缴地主管税务机关办理汇算清缴申报时进行专项附加扣除，税款多退少补；个人所得税专项附加扣除信息随纳税申报表一并报送：①不愿意通过单位办理扣除，未将相关专项附加扣除信息报送给任职受雇单位的；②没有工资、薪金所得，但有劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得的；③有大病医疗支出项目的；④纳税年度内未享受或未足额享受专项附加扣除等情形。
如果同时有两个以上发工资的单位，那么对同一个专项附加扣除项目，在一个纳税年度内，您只能选择从其中的一个单位办理扣除。
专项附加扣除住房贷款利息支出
专项附加扣除住房贷款利息支出是指，夫妻双方婚前分别购买住房发生的首套住房贷款，婚后可以选择其中一套购买的住房，由购买方按扣除标准的100%扣除，也可以选择由夫妻双方对各自购买的住房分别按扣除标准的50%扣除，具体扣除方式在一个纳税年度内不能变更。
