如果公司法定代表人私人账户存在大额的现金流水，与公司实际经营的流入流出没有直接关系，一般问题不是很大。但如果公司法定代表人的私人账户用于公司的结算业务，且无法分清的时候，预期会有麻烦。
有这样一家高新技术企业(甲企业)，企业经营的不错，并开始启动新三板挂牌计划，但聘请会计师事务所到公司审计时，审计机构发现企业的资金结算有部分是用法定代表人的个人账户结算的，同时发现法定代表人个人账户资金流入和流出很频繁，远高于企业经营的流入和流出。
审计机构按照资金流向的脉络，发现公司法定代表人的个人账户不仅存在甲企业的结算业务，还有其他内容的流入流出业务，而且很难界定清楚，同时还存在没有开具发票的情形。审计机构要求甲企业进行整改，该补交的税款及时补缴，公司的资金结算业务不得通过法定代表人的个人账户进行。
1、一般情况下，税务机关不会轻易查询老板的私人账户，这也是有些企业老板铤而走险的原因之一。但是，法定代表人私人账户大量的现金流出和流入，会引起银行的关注，是否存在洗钱行为，或变相转移资金的行为时，银行会查询法定代表人的私人账户，如果存在涉嫌偷税，则税务机关会介入调查。
还有的企业将资金倒来倒去，最后倒到了老板的个人账户，达到偷税的目的。那么税务机关有权对老板的私人账户进行检查。
2、企业因截留企业营业收入、虚开发票等，存在偷漏税行为被举报到税务机关时，税务机关有权对公司法定代表人的私人账户进行核查，同时也会对公司的财务账目、纳税申报资料、业务信息等内容进行稽查。
企业通过法定代表人私人账户进行资金结算的风险还是很大的，而且有的个别企业通过资金转来转去，帮助法定代表人逃避个人所得税，这种做法就是偷税，后果真的很严重。
3、金三系统的预警功能，如果企业的现金流入流出、与企业的库存、发票开具、税负率等存在偏差时，金三系统会对该企业的纳税情况进行预警，而引起税务机关的关注。当税务机关电话询问，或要求企业提供经营信息、财务信息和纳税信息时，如果企业的纳税行为一切正常，还好。如果企业存在偷税漏税的行为时，也会由于法定代表人私人账户的大额资金流水，而被税务机关稽查。
总之，如果老板私人账户大量的资金流水，与企业的生产经营没有直接关系，一般没有问题。但如果企业的结算业务和法定代表人的个人资金收支都通过法定代表人的私人账户结算，且不能区分清楚，那么企业被税务机关稽查的风险还是存在的。
