在审查起诉阶段,如果检察院发现有新的犯罪事实,且事实清楚、证据充分,那么检察院可以考虑直接起诉或者将案件退回公安机关进行补充侦查。这种情况属于检察院在管辖范围内进行的自行侦查。人民检察院审查案件，可以要求公安机关提供法庭审判所必需的证据材料;认为可能存在本法第五十四条规定的以非法方法收集证据情形的，可以要求其对证据收集的合法性作出说明。
人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。
二、检察院审查起诉阶段要查明什么内容?
根据《刑事诉讼法》第168条的规定，人民检察院审查案件的时候，必须查明以下内容：
1、事实清楚
证据是否确实、充分，犯罪性质和罪名的认定是否正确。查明犯罪事实、情节，是正确定罪量刑的前提，查明证据是否确实、充分，是正确定罪量刑的依据和基础。
2、其他责任
人民检察院追诉犯罪应当客观、全面，因此，在审查起诉时要注意审查有无遗漏犯罪嫌疑人的罪行和其他应当追究刑事责任的人。要查清案件的全部犯罪事实，就必须查清犯罪嫌疑人的全部罪行，对共同犯罪案件要查获所有实施犯罪的人。
3、是否追责
保障无罪的人不受刑事追究是人民检察院的职责之一，因此，人民检察院在审查案件时，必须查明犯罪嫌疑人有无不应追究刑事责任的情形，《刑事诉讼法》第十五条对不应追究刑事责任的情形作了明确的规定。
4、侦查合法
人民检察院审查起诉的过程，也是对侦查工作进行法律监督的过程。因此，人民检察院对案件进行审查时，要注意审查侦查人员的侦查活动是否符合法定程序，法律手续是否完备，特别要查明在讯问犯罪嫌疑人和询问证人的过程中是否有刑讯逼供和以威胁、引诱、欺骗以及其他非法方法收集证据的情况。
审查起诉新犯罪如何处理？
律师回答
摘要：在审查起诉阶段,检察院可以考虑直接起诉或退回公安机关进行补充侦查。对于需要补充侦查的案件,检察院可以退回公安机关补充侦查,也可以自行侦查。补充侦查以二次为限,补充侦查完毕移送人民检察院后,人民检察院重新计算审查起诉期限。检察院在审查起诉阶段需要查明事实清楚、证据充分,以及侦查合法。
延伸阅读
结语：在审查起诉阶段,检察院可以考虑直接起诉或退回公安机关补充侦查,对需要补充侦查的案件,可以自行侦查。审查起诉阶段要查明事实清楚、证据充分,犯罪性质和罪名的认定正确,有无遗漏犯罪嫌疑人的罪行和其他应当追究刑事责任的人,以及侦查活动是否符合法定程序。
法律依据
最高人民法院关于适用《刑事诉讼法》的解释(2021-01-26)\t第六百一十条\t在省、自治区、直辖市或者全国范围内具有较大影响的犯罪案件，或者犯罪嫌疑人、被告人逃匿境外的犯罪案件，应当认定为刑事诉讼法第二百九十八条第一款规定的“重大犯罪案件”。
最高人民法院关于适用《刑事诉讼法》的解释(2021-01-26)\t第三百七十条\t具有下列情形之一的，不适用速裁程序：
（一）被告人是盲、聋、哑人的；
（二）被告人是尚未完全丧失辨认或者控制自己行为能力的精神病人的；
（三）被告人是未成年人的；
（四）案件有重大社会影响的；
（五）共同犯罪案件中部分被告人对指控的犯罪事实、罪名、量刑建议或者适用速裁程序有异议的；
（六）被告人与被害人或者其法定代理人没有就附带民事诉讼赔偿等事项达成调解、和解协议的；
（七）辩护人作无罪辩护的；
（八）其他不宜适用速裁程序的情形。
最高人民法院关于适用《刑事诉讼法》的解释(2021-01-26)\t第六百二十一条\t对申请没收违法所得的案件，人民法院审理后，应当按照下列情形分别处理：
（一）申请没收的财产属于违法所得及其他涉案财产的，除依法返还被害人的以外，应当裁定没收；
（二）不符合刑事诉讼法第二百九十八条第一款规定的条件的，应当裁定驳回申请，解除查封、扣押、冻结措施。
申请没收的财产具有高度可能属于违法所得及其他涉案财产的，应当认定为前款规定的“申请没收的财产属于违法所得及其他涉案财产”。巨额财产来源不明犯罪案件中，没有利害关系人对违法所得及其他涉案财产主张权利，或者利害关系人对违法所得及其他涉案财产虽然主张权利但提供的证据没有达到相应证明标准的，应当视为“申请没收的财产属于违法所得及其他涉案财产”。
最高人民法院关于适用《刑事诉讼法》的解释(2021-01-26)\t第三百七十条\t具有下列情形之一的，不适用速裁程序：
（一）被告人是盲、聋、哑人的；
（二）被告人是尚未完全丧失辨认或者控制自己行为能力的精神病人的；
（三）被告人是未成年人的；
（四）案件有重大社会影响的；
（五）共同犯罪案件中部分被告人对指控的犯罪事实、罪名、量刑建议或者适用速裁程序有异议的；
（六）被告人与被害人或者其法定代理人没有就附带民事诉讼赔偿等事项达成调解、和解协议的；
（七）辩护人作无罪辩护的；
（八）其他不宜适用速裁程序的情形。
最高人民法院关于适用《刑事诉讼法》的解释(2021-01-26)\t第六百二十一条\t对申请没收违法所得的案件，人民法院审理后，应当按照下列情形分别处理：
（一）申请没收的财产属于违法所得及其他涉案财产的，除依法返还被害人的以外，应当裁定没收；
（二）不符合刑事诉讼法第二百九十八条第一款规定的条件的，应当裁定驳回申请，解除查封、扣押、冻结措施。
申请没收的财产具有高度可能属于违法所得及其他涉案财产的，应当认定为前款规定的“申请没收的财产属于违法所得及其他涉案财产”。巨额财产来源不明犯罪案件中，没有利害关系人对违法所得及其他涉案财产主张权利，或者利害关系人对违法所得及其他涉案财产虽然主张权利但提供的证据没有达到相应证明标准的，应当视为“申请没收的财产属于违法所得及其他涉案财产”。
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