医院虽然在进行事业单位的改革，主要是在人事制度上。即打破铁饭碗实行聘用制。医院作为事业单位性质是没有发生改变的。因此还是会参照公务员行政体系进行级别的划分。
那如何与公务员行政级别进行对应呢?首先取决于医院的等级。不同的医院等级享有不同的行政级别。比如按照《医院分级管理标准》，医院共分三级十等:1、一级医院，副科单位，院长为副科干部;2、二级医院是跨社区或乡镇的地方性医院，一般为正科建制单位，院长为正科干部;3、三级医院都是设置在地级市，承担一个城市的主要医疗服务，所以三级甲等医院建制为正处，那么院长和书记行政级别也就为正处。
虽然三甲医院大多数建制行政级别都是为正处，院长对应为正处级干部，对于地方性的三甲医院，省卫健委主任作为直接上司，肯定更大。
而一些比较知名的医院，建制级别会比较高。比如目前全国医院综合排名靠前的:北京协和医院、四川大学华西医院、复旦大学附属中山医院、广州中山一院、上海华山医院、解放军总院、上海瑞金医院、北京天坛医院、西安西京医院、上海仁济医院、广东省人民医院、武汉同济医院。这些在全国响当当的医院一般情况下都是副厅级单位。
所以这些医院的院长原则上也就是副厅，而省卫健委主任肯定是厅级干部，在行政级别上，属于正厅级干部的卫健委主任大于三甲医院院长。
即使在一些特殊情况下，比如比如复旦大学附属中山医院院长基本上都是复旦大学常务副校长兼任。那么复旦中山医院院长就是正厅级干部，此时很多人就会觉得，复旦中山医院院长“权力”就于卫健委主任一样大。
其实行政级别可能没有差别多少，但是在实际中，上海的卫健委主任还是比复旦大学附属中山医院院长要更大，这是因为:
一、性质上。卫健委是卫生领域的主管行政部门，基本上能够对医院的医疗事物进行管理。 中山医院是负责医疗服务的。从这个角度上来说，上海卫健委是复旦附属中山医院的上级管理部门。
二、权力实施范围。复旦附属中山医院院长只能在中山医院范围内行使“权力”，而卫健委主任是管理整个上海的大大小小医疗机构。
写在最后:行政性质就决定了卫健委主任是大于全国这些知名三甲医院院长的。结论为:北京协和、华西、复旦中山等医院院长和省卫健委主任相比，省卫健委更大。
北京协和、华西、复旦中山等医院院长和省卫健委主任，谁大
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