一、非营利性医疗机构所得税怎样缴纳
《财政部、国家税务总局关于非营利组织免税资格认定管理有关问题的通知》(财税〔2009〕123号)规定，经有权部门批准设立或登记的非营利组织，符合一定条件的，可以向税务机关提出免税资格认定。经认定后，对于其取得的符合《财政部、国家税务总局关于非营利组织企业所得税免税收入问题的通知》(财税〔2009〕122号)规定的符合免税收入范围的收入，免于征收企业所得税。对于未经过免税资格认定的，其取得的全部收入，或虽经过免税资格认定，但其取得的收入不符合免税收入条件的，均应计征企业所得税。
二、非营利性医疗机构的税收政策
根据财政部、国家税务总局《关于医疗、卫生机构有关税收政策的通知》(财税<2 o="">4 2 号)，对营利性医疗机构有关政策是：该机构取得的收入应按规定征收各种税收。为了支持营利性医疗机构自身的发展，对营利性医疗机构取得的收入，直接用于改善医疗卫生条件的，可自取得执业登记之日起，三年内给予以下优惠政策：对其取得的医疗收入免征营业税;对其自用的房产土地、车船，免征房产税、城镇土地使用税、车船使用税。
对非营利性医疗机构的政策是：
(1)按照国家规定取得的医疗收入免征各种税收，不按照国家规定价格取得的收入，不得享受这项政策。
(2)从事非医疗服务取得的收入，应按照规定征收各种税收。
(3)非营利性医疗机构将取得的医疗服务收入，直接用于改善医疗条件的部分，经税务部门批准，可抵扣其应纳税所得额，就其余额征收企业所得税;
(4)对非营利性医疗机构自用的房产、土地、车船免征房产税、城镇土地使用税、车船使用税。
