公司病假有效诊断证明一般都是需要原件的，而自己一般是留复印件，这样才算是合理合法的，用人单位也没有任何的资格扣取自己的工资，病假也会根据自己的工作年限来进行计算，如果超来就会扣取自己的工资。
一般是要留原件的;
《劳动法》《劳动合同法》都没有对此进行规范，也就是说此种情形下应该依照公司内部章程来看了，公司章程要求如何就对你具有约束力，应该按照章程要求进行，你可以去查询公司的规定。
对于你的担心，可以在上交原件的同时，请求公司开具相关的证明材料，证明原件已交由公司保管，这样即便被迫打官司或进行劳动仲裁，在庭上你也有充足的理由将该项证据的举证责任交由公司负责。
二、病假的工资计算方式
1、对于病假工资，用人单位可以在合同中与职工进行约定，只要不低于当地最低工资的80%就可以。根据劳动部《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》中的规定，职工全年月平均工作天数和工作时间分别调整为0.9天和67.4小时，可以照此折算出员工日平均工资。
2、对于事假工资，企业完全可以不支付。
3、职工请事假(含病假)期间的工资待遇，国家机关和事业单位实行照发工资的制度。企业根据职工的不同性质而实行不同的制度，企业中的工人由于享受加班加点工资待遇，所以一般在事假期间不发工资;企业中的行政人员和工程技术人员不享受加班加点工资待遇，请事假每个季度在两个工作日以内的，照发工资，超过两个工作日以上的，其超过天数不发工资。
职工休探亲假期间的工资待遇，在规定的探亲假期间和路程期间内，照发本人的标准工资。
职工本人结婚或职工的直系亲属(父母、配偶、子女)死亡时，经过单位领导批准，给予一至三天的婚丧期。职工结婚时双方不在一地工作的，职工在外地的直系亲属死亡时需要职工本人前去料理丧事的，可以根据路程远近，给予路程假。在批准的婚丧假和路程假期间，工资照发。
职工可以享受本单位的带薪年休假。年休假一般为5至15天。
三、工资的具体内容有:
(1)职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期间内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
(2)除劳动法第二十五条规定的情形外，劳动者在医疗期、孕期、产期和哺乳期内，劳动，劳动合同期限届满时，用人单位不得终止劳动合同。劳动合同的期限应自动延续至医疗期、孕期、产期和哺乳期期满为止。
(3)请长病假的职工在医疗期满后，能从事原工作的，可以继续履行劳动合同;医疗期满后仍不能从事原工作也不能从事由单位另行安排的工作的，由劳动鉴定委员会参照工伤与职业病致残程度鉴定标准进行劳动能力鉴定。被鉴定为一至四级的，应当退出劳动岗位，解除劳动关系，办理因病或非因工负伤退休退职手续，享受相应的退休退职待遇;被鉴定为五至十级的，用人单位可以解除劳动合同，并按规定支付经济补偿金和医疗补助费。
(4)《劳动法》第四十八条中的“最低工资”是指劳动者在法定工作时间内履行了正常劳动义务的前提下，由其所在单位支付的最低劳动报酬。最低工资不包括延长工作时间的工资报酬，以货币形式支付的住房和用人单位支付的伙食补贴，中班、夜班、高温、低温、井下、有毒、有害等特殊工作环境和劳动条件下的津贴，国家法律、法规、规章规定的社会保险福利。
(5)劳动者患病或者非因工负伤，经劳动鉴定委员会确认不能从事原工作、也不能从事用人单位另行安排的工作而解除劳动合同的，用人单位应按其在本单位的工作年限，每满一年发给相当于一个月工资的经济补偿金，同时还应发给不低于六个月工资的医疗补助费。患重病和绝症的还应增加医疗补助费，患重病的增加部分不低于医疗补助费的百分之五十，患绝症的增加部分不低于医疗补助费的百分之百。
综合上面所说的，病假是允许劳动者请的，但是必须要符合条件才能进行使用，而且还需要医院开具自己的病情证明才能更好的处理自己的事情，所以，请病假一定要按照法律规定的流程来进行，这样才能更好的保障自己的合法权益。
