行驶证被扣违章处理分以下两种情况:
1、未扣满12分的,本人拿着违章回执单、身份证、驾驶证,去去违法地车管所处理,扣留机动车驾驶证的期限至作出处罚决定为止,并开具行政强制措施凭证,处理完后就可以领取行驶证。
2、已扣满12分的,将会暂扣驾驶证,需要重新学习科目一,考试通过后取回驾驶证,再带上驾驶证、身份证、行驶证被扣凭证到车管所领回行驶证即可。
违章是属于违反了交通法,只要一旦被查到违章那么就会要进行处罚,但如果行驶证被扣了,那么就要到相关的部门进行办理缴纳,等扣留的期限满了之后才会归还行驶证。