不会的,依照法律规定,派出所已经立案的仍然会将案件移送检察院审查起诉,然后检察院向法院提起公诉,检察院认为情节轻微的,也可以不起诉。当事人之间达成调解协议或者和解协议,属于从轻处罚情节;对于检察院不起诉的,因是无罪处罚,不会留案底,如果派出所未刑事案件立案,而立的是治安案件,派出所调解后就有可能不移送起诉了,就不会有案底。
【本文关联的相关法律依据】
《刑事诉讼法》第二百八十九条:“和解协议的审查与制作,双方当事人和解的,公安机关、人民检察院、人民法院应当听取当事人和其他有关人员的意见,对和解的自愿性、合法性进行审查,并主持制作和解协议书。”第二百九十条:“和解协议的效力,对于达成和解协议的案件,公安机关可以向人民检察院提出从宽处理的建议。人民检察院可以向人民法院提出从宽处罚的建议;对于犯罪情节轻微,不需要判处刑罚的,可以作出不起诉的决定。人民法院可以依法对被告人从宽处罚。”