1、坚持申请重新鉴定。2、向司法行政机关投诉反映，以达到撤销违法司法鉴定结论的目的。3、主动搜集其他证据推翻鉴定结论，使得鉴定结论不能作为定案证据。
一、对刑事司法鉴定有异议怎么办?
1、坚持申请重新鉴定。
如果因鉴定结论错误不服而要推翻，则一定要坚持申请重新鉴定。那么取得法官对重新鉴定的支持就是首要目的。当事人就不能单纯的只是提出申请，而要围绕重新鉴定申请准备充分合理的理由，要尽量搜集证据，要尽其所能。比如对鉴定结论提出充分有据合法合理的异议，包括针对鉴定程序和鉴定结果等等。
2、向司法行政机关投诉反映，以达到撤销违法司法鉴定结论的目的。
如果司法鉴定机构违法违纪进行司法鉴定活动，则可以向省级司法行政部门投诉。司法行政部门可以对其违法行为进行调查和处理从而使得原鉴定结论作废或者司法鉴定结构主动撤销违法的鉴定结论。
当前的司法鉴定实践中，鉴定机构作为商业主体很多都存在委托受理把关不严，鉴定结论草率，鉴定程序不规范，鉴定暗箱操作及受贿堕落的问题。所以投诉举报司法鉴定机构违法行为的方式也是可以考虑选择的。
3、主动搜集其他证据推翻鉴定结论，使得鉴定结论不能作为定案证据。
细心的当事人会发现，正规的司法鉴定意见书首页会有一份“声明”。其内容往往包括什么委托人应当向鉴定机构提供真实、完整、充分的鉴定材料，并对鉴定材料的真实性、合法性负责之类的话语。言外之意，鉴定意见是基于检材真实、完整、充分、合法等基础之上。如果我们能够搜集到有关否定检材真实、完整、充分、合法的证据，则鉴定意见失去基础，自然不能作为定案证据。
二、哪些情况下，可以重新鉴定?
有下列情形之一的，司法鉴定机构可以接受委托进行重新鉴定:
1、原司法鉴定人不具有从事原委托事项鉴定执业资格的;
2、原司法鉴定机构超出登记的业务范围组织鉴定的;
3、原司法鉴定人按规定应当回避没有回避的;
4、委托人或者其他诉讼当事人对原鉴定意见有异议，并能提出合法依据和合理理由的;
5、法律规定或者人民法院认为需要重新鉴定的其他情形。
由此可见，当鉴定机构出具司法鉴定意见书后，当事人对刑事司法鉴定有异议的话，可以申请重新鉴定、或者进行行政诉讼，要求撤回鉴定，再者，当事人可以通过自己收集证据，来推翻司法鉴定的结论。像司法鉴定过程违规、鉴定办法适用错误、鉴定人不具备资格等，都是重新鉴定的情形。
