新生儿的农村医疗保险可由其父母或者户主来向当地的社保经办机构来申请办理。其父母或者户主可以递交户口本、本人的身份证、新生儿的出生证明等材料，由社保经办机构审核，审查通过的，则予以登记，发给医保卡。
新生儿医保办理步骤：
第一步，为新生儿办理入户手续。只有在新生儿取得本市户籍以后，才有资格参加婴儿医疗保险。
第二步，到当地的医保服务点为新生儿办理参保手续，同时缴纳相应的费用。在办理参保手续时，家长应向工作人员提供户口本、出生证等资料的原件和复印件。
第三步，领取门诊医疗的就医凭证。这个凭证包括《社会保障卡》和《就医记录册》。
第四步，领取住院医疗的就医凭证。这个凭证是指《少儿住院基金医疗证》。
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法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》
第二十三条
职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。
第二十五条
国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。
城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。
