法律分析：一、工伤认定公司不配合怎么处理
工伤认定公司不配合如下处理：
用人单位不配合的，受伤职工可以自己申请工伤认定，也可以通过仲裁劳动关系确认。用人单位不认可是工伤，用人单位负有举证责任。因此劳动保障行政部门可以要求用人单位提供相应的证据，如果其拒绝举证，那么行政机关可以根据受害职工一方提供的证据，来做出工伤结论。
二、工伤认定的性质特点
1.属于具体行政行为;
2.属于行政确认行为。确认的结果有四种：是工伤，非工伤，视同工伤，不视同工伤;
3.属于须申请的行政行为。不申请，不认定是工伤认定程序的特点。
4.单位、职工或其近亲属一方对工伤认定结论不服的，可以选择申请行政复议或者进行行政诉讼。
三、申请工伤认定需要的材料有哪些
1.伤者居民身份证或死者居民身份证。
2.伤者或死者家属委托律师或其他人代理申请工伤认定的：
(1)委托律师代理的，律师需要向劳动局提交律师事务所函和伤者或死者家属的授权委托书，随身携带律师证备验；
(2)委托其他人代理的，需要向劳动局提交伤者或死者家属的授权委托书和代理人的居民身份证。
3.工伤认定申请表。
4.与用人单位存在劳动关系(包括事实劳动关系)的证明材料。
5.医疗机构出具的受伤后的诊断证明书，或者职业病诊断机构(或鉴定机构)出具的职业病诊断证明书(或职业病诊断鉴定书)。
6.受伤害职工就医医院出具的病历。
法律依据：《工伤保险条例》第十七条
职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
