员工可以直接向社保行政主管部门投诉，发生工伤纠纷并不代表公司可以停交社保，无正当理由停交社保的行为是违法的，经过调查确认情况属实的，社保行政主管部门会依法对公司进行处罚，并责令公司限期补足社保。
工伤纠纷中停交社保的，可以向社会保险费征收机构投诉，情况属实的，由社会保险费征收机构责令限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金。
《社会保险法》
第八十六条
用人单位未按时足额缴纳社会保险费的，由社会保险费征收机构责令限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金;逾期仍不缴纳的，由有关行政部门处欠缴数额一倍以上三倍以下的罚款。
二、工伤纠纷中做工伤认定的流程有哪些?
1、申请人备齐工伤认定申请表和职工身份证等相关资料，到社保机构提出工伤认定申请;
2、机构工作人员受理资料，并对资料进行审核;
3、机构决定受理的，出具受理文书，并送达申请人;
4、机构经审查和调查取证，作出工伤认定决定;
5、依法将认定文书送达受伤害职工、其近亲属和用人单位。
三、工伤纠纷的仲裁流程有哪些?
1、提交申请书。
当事人申请仲裁，应当提交书面仲裁申请书，并按照被申请人数提交副本。
2、仲裁受理。
仲裁委员会应当自收到仲裁申请之日起五日内作出受理或者不予受理的决定。仲裁委员会决定受理的，应当自作出决定之日起五日内将申诉书副本送达被申请人。决定不予受理的，应当说明理由。
3、开庭审理。
仲裁庭应当于开庭的五日前，将开庭日期、地点书面通知双方当事人。无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，对申请人按照撤诉自理，对被申请人可以做缺席裁决。
4、仲裁调解。
仲裁庭处理劳动争议应当先行调解，在查明事实的基础上促使当事人双方自愿达成协议。调解达成协议的，仲裁庭应当根据协议内容制作调解书，调解书自送达之日起具有法律效力;调解未达成协议的，仲裁庭应当及时裁决。
5、仲裁裁决。
仲裁庭裁决劳动争议案件，应当自劳动仲裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。案情复杂需要延期的，经批准可以延期并书面通知当事人，延长期限不超过十五日。仲裁庭裁决后应当制作仲裁书送达双方当事人。当事人对仲裁裁决不服的，自收到裁决书之日起十五日内，可以向人民法院起诉;期满不起诉的，裁决书即发生法律效力。
只要双方没有解除劳动关系，用人单位就不能停交社保，发生工伤纠纷也不是用人单位单方面解除劳动合同的正当理由。社保费用现在是由税务机关统一征收的，所以针对公司停交社保的做法，员工可以收集证据向税务部门投诉。
