自然人税收管理系统扣缴流程
1、人员信息采集：先在“人员信息采集”填写人员信息，人员状态选择“正常”，是否雇员选择“是”；2、报表填写：点击“报表填写”→“扣缴所得税报告表”→“正常工资薪金”，点击“导入”→“导入数据”选择生成零工资记录，用户手工修改；3、申报表报送：确认填写无误后请您点击“申报表报送”，再点击上方发送申报“，发送报表并及时点击获取反馈反馈，申报结果显示成功就可以了；注：0申报无需扣款。
自然人税收申报时间
1、扣缴义务人每月所扣的税款，自行申报纳税人每月应纳的税款，都应当在次月15日内缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。2、工资、薪金所得应纳的税款，按月计征，由扣缴义务人或者纳税义务人在次月15日内缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。两处或者两处以上取得工资、薪金收入的纳税人，在实行单位代扣代缴的同时，纳税人应将其多处取得的“工资、薪金收入”合并按税法规定扣除一次费用，选择并固定在其中一地税务机关自行申报纳税。对单位已扣的税款，可凭完税凭证在应纳税款中抵扣。特定行业的工资、薪金所得应纳的税款，可以实行按年计算、分月预缴的方式计征，具体办法由国务院规定。个体工商户的生产、经营所得应纳的税款，按年计算，分月预缴，由纳税义务人在次月15日内预缴，年度终了后三个月内汇算清缴，多退少补。
个人所得税扣缴申报表
扣缴义务人每月或者每次预扣、代扣的税款，应当在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送扣缴个人所得税申报表。纳税人办理汇算清缴退税或者扣缴义务人为纳税人办理汇算清缴退税的，税务机关审核后，按照国库管理的有关规定办理退税。专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等；专项附加扣除，包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出，具体范围、标准和实施步骤由国务院确定，并报全国人民代表大会常务委员会备案。
个人所得税通过扣缴义务人申报
纳税人选择申报方式为“通过扣缴义务人申报”，则单位在使用扣缴端软件时，在“专项附加扣除信息采集”模块，选择需要同步的专项项目，点击【更新】，可以获取选择企业扣缴申报的员工的专项附加扣除信息；这种方式下，纳税人可以在预扣预缴期间享受扣除。
自然人申报个人所得税的流程是什么
1、领取申报表： 纳税人到办税服务厅申报纳税窗口领取《个人所得税纳税申报表》2份并填写，年所得12万元以上的纳税人办理个人所得税纳税年度申报的，领取《个人所得税申报表(适用于年所得12万元以上的纳税人申报)》2份并填写。2、办理申报： 纳税人持上述办理材料到办税服务厅申报纳税窗口进行申报。 另：年所得12万元以上的纳税人，应当填写《个人所得税纳税申报表(适用于年所得12万元以上的纳税人申报)》，并在办理纳税申报时报送主管税务机关，同时报送个人有效身份证件复印件，以及主管税务机关要求报送的其他有关资料。 3、缴纳税款： (1)当期申报没有税款的，经税务机关审核，纳税人提供的资料完整、填写内容准确、各项手续齐全、无违章问题，符合条件的，当场办结，并在《个人所得税纳税申报表》上盖章，返还一份给纳税人。 (2)当期申报有税款的，纳税人需缴纳税款，税务机关确认税款缴纳后开具完税凭证予以办结。
《中华人民共和国个人所得税法》第三条
