医保和合作医疗的区别如下：
1、所覆盖的对象不同，新型农村合作医疗只有农民才可以参加，必须以家庭为单位整户参加，；而城镇职工基本医疗保险是用人单位和个人缴费建立的医疗保险基金；
2、缴费方式不同，新型农村合作医疗是农民自愿参加，；城镇职工基本医疗保险费是用人单位和职工共同缴纳的；
3、待遇不同，新型农村合作医疗费用补助；而城镇职工基本医疗保险是参保人除了享受个人账户费用门诊包干，还可以享受住院医疗。
一、医保卡的办理方式如下：
1、参保人携带本人有效证件，至邻近的区县医保中心申请办理，区县医保中心当场予以办结；
2、参保人也可以至邻近的街道医保事务服务点申请代为办理；
3、参保人可以委托他人代为办理。被委托人在办理时需携带本人及参保人的有效证件；
4、用人单位集中办理时，可凭单位介绍信及经办人本人有效证件至所属的区县医保中心办理，然后由用人单位将《医保卡》发给参保人。
二、合作医疗的作用如下：
1、合作医疗，全称新型农村合作医疗保险，是在群众自愿互助的基础上，依靠集体经济，在防病治病上实行互济互助的一种福利性质的医疗制度。合作医疗，是由我国农民自己创造的互助共济的医疗保障制度，在保障农民获得基本卫生服务、缓解农民因病致贫和因病返贫方面发挥了重要的作用；
2、新型农村合作医疗制度正是应农民对医疗保障的迫切需要而产生，为农民的健康提供了一定的制度保障。这一制度实行社会统筹与个人账户相结合的模式，大病实现统筹，个人账户可以累积转存，解决了农民的医疗保障问题，增强了农民的自我保健和保障意识；
3、新型合作医疗为大病医疗提供了保障，新型农村合作医疗制度提供了大病统筹机制。
总之，医保和合作医疗的区别分别是不同地区所覆盖的对象不同、不同地区的缴费方式不同、不同地区的待遇不同。医保卡可以到邻近的区县医保中心申请办理，可以至邻近的街道医保事务服务点申请代为办理，可以委托他人代为办理
法律依据
《中华人民共和国社会保险法》第二十三条职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。第二十五条国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。
城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。
享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。第二十六条职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
