一、分居三年是否可以自动离婚
婚姻关系只能通过离婚登记或者法院判决或调解的方式解除。分居，不管时间多长，都不能自动解除婚姻关系。但是，按照民法典的规定，夫妻因感情不和分居满二年，则构成夫妻感情确已破裂，在诉讼中，如果调解不成，应当判决准予离婚。但是非因感情不和而分居的，不能适用该项规定。
二、民法典有关规定
第一千零七十九条男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：
(一)重婚或有配偶者与他人同居的;
(二)实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的;
(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改的;
(四)因感情不和分居满二年的;
(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的，应准予离婚。
解除婚姻关系只有两种途径：到婚姻登记管理机关协议办理，或到人民法院判决/调解办理，目前，我国法律不承认分居2年就可以自动解除婚姻关系。
任何人都不愿意将争议诉诸法院，除非万不得已。因此，协议离婚，无疑是解除婚姻关系的最佳选择。特别是新的婚姻登记条例颁布后，离婚不再需要当事人单位开具介绍信，个人隐私受到了保护，协议离婚更加方便快捷。但对于双方户口远在外省(市)、而在上海工作生活的当事人来说，通过法院调解离婚，应该更为方便。如果方法得当，所需费用仅为五十元，可能比回户口所在地的单程车票还便宜，所需时间如果安排得当也不用一个月。另外，对于一方在国外，无法办理国内协议离婚手续，或婚姻缔结地在国外，而欲在国内离婚的当事人，法院解决无疑是唯一的途径。
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