法律分析：一、港澳通行证可以坐飞机吗
在有效期内的港澳通行证，国内乘坐航班可以用来代替身份证乘坐飞机的，因为港澳通行证也是中国公民的有效证件之一。
港澳通行证俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。
民航局规定，中国籍旅客乘机的有效证件包括居民身份证、临时身份证，军官证、武警警官证，士兵证、军队学员证、军队文职干部证、军队离退休干部证和军队职工证，港、澳通行证，护照等有效证件;
港澳地区居民和台湾同胞旅行证件包括：外籍旅客的护照、旅行证，外交官证等民航总局规定的其他有效乘机身份证件。
二、如何申请港澳通行证
申请港澳通行证流程如下：
1、提交申请。申请人可先在网上提前预约申请，或直接到现场提出申请，并按照规定填写中国公民出入境证件申请表，准备好需要提交的相关证明材料；
2、数码照相。申请人需要提交本人数码照片两张，可直接在现场进行拍照；
3、采集指纹。申请人在工作人员的指引下进行指纹采集或者核验指纹，16周岁以下的申请人是否采集指纹根据其监护人的意见确定，采集后拿号等待办理；
4、受理申请。工作人员对申请人提交的材料进行初审，并出具缴费单给申请人；
5、缴纳费用。申请人到指定窗口缴纳办证及签注所需的费用，制证费用100元，签注费用以签注类型而定，并领取回执单；
6、制作证件。受理申请后，由省公安机关出入境管理机构负责制作电子港澳通行证，并将制作好的证件送回接受申请的出入境管理机构；
7、发放证件。申请人在制证完成后，到办理的出入境管理机构领取证件；若选择快递形式收件的话，只需等候快递人员上门进行签收即可。
法律依据：《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》第六条
内地公民因私事前往香港、澳门，须向户口所在地的市、县公安局出入境管理部门提出申请。
第九条
内地公民因私事申请前往香港、澳门，须回答有关询问并履行下列手续：
（一）交验户口簿或者其他户籍证明。
（二）填写申请表；
（三）提交所在工作单位对申请人前往香港、澳门的意见；
（四）提交与申请事由相应的证明。
