法律分析：一、工人仲裁赢了,单位申请破产了怎么办?
可以进行债务清偿。
公司申请破产成功后，公司的破产财产在清偿破产费用和共益债务后，会优先用于支付员工的工资，所以不用担心工资还拿不到。但如果公司已经没有财产，债务也只能归于消灭。
在劳动仲裁中赢了，而遇到公司破产的，适用《破产法》进行财产清算，清算后的财产用于偿还欠款，分配时，优先支付拖欠的职工工资和社会保险费用。如果经清算，公司已经没有财产，则分配结束，所有的公司债务都归于消灭(也包括拖欠的职工工资等)。
在劳动仲裁期间不用担心公司破产了，没有可执行资产的问题。只能建议拿到仲裁裁决生效后，尽快申请法院强制执行，在强制执行期间，企业是不可以宣布破产及注销的。
根据我国《劳动争议调解仲裁法》：第三十六条申请人收到书面通知，无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，可以视为撤回仲裁申请。被申请人收到书面通知，无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，可以缺席裁决。
第五十一条当事人对发生法律效力的调解书、裁决书，应当依照规定的期限履行。一方当事人逾期不履行的，另一方当事人可以依照民事诉讼法的有关规定向人民法院申请执行。受理申请的人民法院应当依法执行。
二、公司破产，财产清偿顺序
员工申请仲裁不影响公司申请破产。公司破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，应当先用于支付员工的工资。
《企业破产法》第一百一十三条破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：
1、破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金;
2、破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款;
3、普通破产债权。
破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。
破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
法律依据：《劳动争议调解仲裁法》：第三十六条申请人收到书面通知，无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，可以视为撤回仲裁申请。
第五十一条当事人对发生法律效力的调解书、裁决书，应当依照规定的期限履行。
《企业破产法》第一百一十三条破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：
1、破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金;
2、破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款;
3、普通破产债权。
