三方协议书丢了，补办流程是：提出书面申请写清楚遗失原因，然后到所在学院签署意见，再到就业指导中心领取新的协议书，每个学校的补办流程可能会略有不同，大家如果有需要直接咨询自己的辅导员老师即可。三方就业协议书是国家教育部统一印制的，主要是明确三方的基本情况及要求。三方就业协议书制定的依据是国家关于高校毕业生就业的法规和规定，有效期为：自签约日起至毕业生到用人单位报到止的这一段时间。
签了三方协议可以不去是否要交违约金需要根据签订的三方协议是否有约定，如果有约定的，就需要支付违约金。找法网提醒您，签订了三方协议，如果没有就业单位提供专项培训、约定服务期，从业人员无须承担违约责任。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第五百零二条
依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。
