法律分析：一、公司和员工签订的协议有法律效力吗
1、公司和员工签订的协议是有法律效力的。劳动合同要由用人单位与劳动者协商一致订立，依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。
2、法律依据：《中华人民共和国劳动法》
第三十六条国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
第三十八条用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
第三十九条企业因生产特点不能实行本法第三十六条、第三十八条规定的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。
二、未签劳动合同发生争议怎么办
1、“建立劳动关系应当签订劳动合同”，“劳动合同应当以书面形式签订”。但在实践中，仍有不少企业与其职工建立劳动关系时，没有签订书面合同，这种情况一般被称为“事实劳动关系”。
2、从劳动法原理上分析，劳
动争议应否受理，是以争议双方是否存在劳动关系，其争议是否属于劳动争议范围来确定，而不是以这种关系是否合乎法定形式来确定的。事实劳动关系尽管存在建立形式上的缺陷，但仍然是劳动关系，属于劳动法的调整范围。因此，事实劳动关系双方当事人发生劳动争议，可以向劳动争议处理机构申诉，有关机构应予受理。
3、用人单位与劳动者发生劳动争议不论是否签订劳动合同，只要存在事实劳动关系，并符合《企业劳动争议处理条例》劳动争议仲裁委员会均应受理。
综上所述劳动者的劳动报酬应该以劳动合同的约定为准，如果只签协协议没签劳动合同的，协议有效，但用人单位违反法律的规定。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》
第三十六条国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
第三十八条用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
第三十九条企业因生产特点不能实行本法第三十六条、第三十八条规定的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。
