职补偿金在计算缴纳个人所得税时要分两部分考虑：一部分为上年社会平均工资3倍以内的部分;一部分为超过上年社会平均工资3倍的部分。
一、不超过当地上年社会平均工资3倍的部分——免征个税
财税【2001】157号：个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入(包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用)，其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税;
二、超过当地上年社会平均工资3倍的部分——按规定征收个人所得税
根据国税发【1999】178号，二、考虑到个人取得的一次性经济补偿收入数额较大，而且被解聘的人员可能在一段时间内没有固定收入，因此，对于个人取得的一次性经济补偿收入，可视为一次取得数月的工资、薪金收入，允许在一定期限内进行平均。具体平均办法为：以个人取得的一次性经济补偿收入，除以个人在本企业的工作年限数，以其商数作为个人的月工资、薪金收入，按照税法规定计算缴纳个人所得税。个人在本企业的工作年限数按实际工作年限数计算，超过12年的按12计算。
所以计算离职补偿金的个人所得税时，离职补偿金超过当地上年平均工资3倍的部分，减除实际缴纳的社保、住房公积金后，除以在企业工作的年数(是长不超过12)，作为月份工资，减除个人所得税免征额3500，找到适用的税率和速算扣除数计算出一个月的个人所得税，再乘以工作年数，作为全部补偿金的个人所得税税款。
三、举例
某员工从甲公司离职，离职时在甲公司工作48个月，从该公司取得离职补偿金25万元，当地社会平均工资为7万元，怎么计算要交的个人所得税?
可免个税的部分为3*7=21万元
按规定要交税的部分为25-21=4万元
平均月工资为4/4=1万元
确定适用税率和速算扣除数：10000-3500=6500，适用税率为20%，速算扣除数为555;
计算个人所得税为：(6500*20%-555)*4=745*4=2980元。
