不同点:1.参加的险种数量不同。灵活就业人员参加的保险主要包括两险或甚至一险。青岛等一些地区都允许只交养老保险。个体工商户参加的保险是五险。尤其是有雇工的个体工商户,实际上个体工商户也是企业老板,应当给打工者交纳社保五险,应对工伤、生育、失业等待遇。2.享受补贴不同。灵活就业人员参保缴费,可以享受灵活就业人员补贴。这是一种面对就业困难人员的灵活就业者,降低他们社保交费的一种方式。政府一般补贴50%~70%。享受期限一般是三年,距离退休不足五年首次申请的可以延迟至退休。个体工商户一般属于创业群体了,可以享受的是一次性创业补贴。