住院花了3万新农合报销如下：
1、乡镇级住院报销起付线200元，3万会报销25500；
2、县级定点医疗机构住院报销起付线500元，3万会报销27000；
3、市级定点医疗机构住院报销起付线700元，3万会报销16500；
4、省级定点医疗机构住院报销起付线是1000元，3万会报销15000。
新农村合作医疗保险的住院报销规定
(一)起付线
一级定点医疗机构100元，起付线以下的医药费用不予报销。二、三级定点医疗机构不设起付线。
(二)报销比例
一级定点医疗机构住院不实行分段补偿，符合报销范围内的医药费补偿比例为65%。二、三级定点医疗机构住院实行分段补偿，分为5000元以下(含5000元)、5000元以上至10000元(含10000元)和10000元以上三段(下同)。
符合报销范围内的医药费按以下比例报销：
二级定点医疗机构5000元以下的部分按50%的比例报销，5000元至10000元的部分按55%的比例报销，10000元以上的部分按60%的比例报销。
三级定点医疗机构5000元以下的部分按35%的比例报销，5000元至10000元的部分按40%的比例报销，10000元以上的部分按照45%的比例报销。
一级定点医疗机构包括镇街道卫生院和区级专科医疗机构，二级定点医疗机构包括区级综合医院和市级专科医疗机构，三级定点医疗机构包括市级及市级以上综合医院、市级以上专科医疗机构。
(三)封顶线
住院报销总额每人每年累计最高可报销40000元。
法律依据
<《民法典》第二百九十条>
《中华人民共和国社会保险法》第二十四条
国家建立和完善新型农村合作医疗制度。新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。
第八条
社会保险经办机构提供社会保险服务，负责社会保险登记、个人权益记录、社会保险待遇支付等工作。
