克扣员工工资该怎么赔偿单位克扣工资的话，劳动者向劳动监察大队投诉举报，具体处理办法：
《劳动保障监察条例》第二十六条
用人单位有下列行为之一的，由劳动保障行政部门分别责令限期支付劳动者的工资报酬、劳动者工资低于当地最低工资标准的差额或者解除劳动合同的经济补偿；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的；
（二）支付劳动者的工资低于当地最低工资标准的；
（三）解除劳动合同未依法给予劳动者经济补偿的。
以下减发工资的情况不属于“克扣”：
(一)国家法律法规中有明确规定的(如法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费等);
(二)依法签订的劳动合同中有明确约定的(如用人单位代扣代缴的个人所得税和应由劳动者个人缴纳的各项社会保险费用等);
(三)用人单位依法制定并经职代会批准的厂规、厂纪中有明确规定的;
(四)企业工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时，工资必须相应下浮的，但支付给劳动者的工资不得低于当地最低工资标准;
(五)因劳动者请事假等相应减发的工资等。随意克扣员工工资是否合法《工资支付暂行规定》第十六条
