发票金额大于付款金额属于违法行为，具体分析如下：
1、发票金额比实际付款金额多，开票方和受票方都违法，但要分析具体情况；
2、开具发票是根据货物销售或提供劳务服务业务的金额开具的，开具发票后，购买货物或接受劳务服务的单位应该根据发票金额，支付货款或服务费，发票金额与实际付款是一致的；
3、发票金额大于实际金额应做会计处理，一般分2种情况进行处理，具体如下：
（1）实际报销金额比发票金额小的不多，或者是实报时抹零了。这种情况可依据实报金额直接入账处理；
（2）实报金额比发票金额小很多，这种情况就应有合理的解释，可让报销经办人据实做出书面说明，并履行报销签批程序，作为报销发票的附件，后按说明中的金额实际报销，票据入账即可。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》第二十条
从事生产、经营的纳税人的财务、会计制度或者财务、会计处理办法和会计核算软件，应当报送税务机关备案。
纳税人、扣缴义务人的财务、会计制度或者财务、会计处理办法与国务院或者国务院财政、税务主管部门有关税收的规定抵触的，依照国务院或者国务院财政、税务主管部门有关税收的规定计算应纳税款、代扣代缴和代收代缴税款。
第二十一条
税务机关是发票的主管机关，负责发票印制、领购、开具、取得、保管、缴销的管理和监督。
单位、个人在购销商品、提供或者接受经营服务以及从事其他经营活动中，应当按照规定开具、使用、取得发票。
发票的管理办法由国务院规定。
第二十二条
增值税专用发票由国务院税务主管部门指定的企业印制；其他发票，按照国务院税务主管部门的规定，分别由省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局指定企业印制。
未经前款规定的税务机关指定，不得印制发票。
